More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0624 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  100 
 
 
214 aa  434  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  99.07 
 
 
214 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  86.92 
 
 
214 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  85.05 
 
 
214 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  86.45 
 
 
214 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  83.18 
 
 
214 aa  367  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  83.18 
 
 
214 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  71.56 
 
 
216 aa  310  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  65.42 
 
 
217 aa  298  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  65.42 
 
 
217 aa  298  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  64.95 
 
 
217 aa  296  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  67.91 
 
 
216 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  64.02 
 
 
214 aa  296  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  66.67 
 
 
215 aa  292  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  64.95 
 
 
216 aa  292  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  65.71 
 
 
215 aa  291  5e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  62.62 
 
 
214 aa  290  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  65.88 
 
 
215 aa  289  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  66.67 
 
 
215 aa  286  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  65.4 
 
 
215 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  66.67 
 
 
215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  62.15 
 
 
217 aa  285  5e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  63.72 
 
 
218 aa  284  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  62.15 
 
 
215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  60.19 
 
 
218 aa  280  9e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  64.49 
 
 
217 aa  280  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  63.98 
 
 
215 aa  280  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  63.98 
 
 
215 aa  280  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  63.98 
 
 
215 aa  280  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  63.98 
 
 
215 aa  280  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  63.98 
 
 
215 aa  280  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  63.98 
 
 
215 aa  280  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  63.98 
 
 
215 aa  280  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  63.98 
 
 
215 aa  280  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  65.73 
 
 
219 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  63.51 
 
 
215 aa  278  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  63.51 
 
 
215 aa  278  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  58.96 
 
 
213 aa  278  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  66.35 
 
 
215 aa  278  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  63.51 
 
 
213 aa  276  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  63.03 
 
 
215 aa  277  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  58.29 
 
 
218 aa  276  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  62.56 
 
 
213 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1489  putative translaldolase  68.84 
 
 
217 aa  275  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0485  transaldolase  56.54 
 
 
214 aa  274  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  57.35 
 
 
223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  60.55 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  60.19 
 
 
216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  59.81 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2403  putative translaldolase  64.15 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  62.62 
 
 
215 aa  270  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  59.62 
 
 
221 aa  269  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  60.65 
 
 
226 aa  269  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  56.87 
 
 
221 aa  268  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  59.07 
 
 
216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  57.94 
 
 
217 aa  266  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  61.61 
 
 
217 aa  266  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  61.79 
 
 
213 aa  267  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  59.46 
 
 
223 aa  266  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  60.65 
 
 
222 aa  265  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1927  putative translaldolase  60.19 
 
 
217 aa  263  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0834254  hitchhiker  0.00000000106475 
 
 
-
 
NC_004310  BR1805  putative translaldolase  61.61 
 
 
217 aa  261  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1738  putative translaldolase  61.61 
 
 
217 aa  261  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1099  putative translaldolase  62.09 
 
 
217 aa  261  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  56.81 
 
 
226 aa  261  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  55.45 
 
 
213 aa  261  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  58.88 
 
 
217 aa  261  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  59.24 
 
 
217 aa  259  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  57.82 
 
 
215 aa  258  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2875  putative translaldolase  59.72 
 
 
222 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1479  transaldolase  63.55 
 
 
217 aa  258  7e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  56.6 
 
 
217 aa  256  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  58.96 
 
 
218 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2476  putative translaldolase  56.94 
 
 
223 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0106  putative translaldolase  57.35 
 
 
217 aa  256  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2088  putative translaldolase  61.26 
 
 
222 aa  255  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  57.21 
 
 
218 aa  255  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  59.72 
 
 
217 aa  254  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3027  transaldolase  59.07 
 
 
221 aa  254  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32955  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  58.29 
 
 
219 aa  254  8e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  58.1 
 
 
215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10763  transaldolase  58.14 
 
 
217 aa  252  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0057  transaldolase  60.85 
 
 
218 aa  251  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  57.42 
 
 
217 aa  251  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  58.41 
 
 
215 aa  250  9.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2390  putative translaldolase  58.29 
 
 
217 aa  250  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2002  putative translaldolase  56.02 
 
 
218 aa  248  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  58.17 
 
 
217 aa  248  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  56.28 
 
 
218 aa  247  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0074  putative translaldolase  58.33 
 
 
222 aa  246  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0348  transaldolase  56.48 
 
 
219 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39583  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4567  putative translaldolase  55.05 
 
 
218 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0244923  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0499  putative translaldolase  53.7 
 
 
217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000254528  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1807  putative translaldolase  58.29 
 
 
216 aa  243  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0561  putative translaldolase  55.92 
 
 
219 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2213  putative translaldolase  55.92 
 
 
219 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  52.58 
 
 
222 aa  241  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2130  putative translaldolase  55.35 
 
 
219 aa  241  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1224  putative translaldolase  55.92 
 
 
219 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  54.63 
 
 
218 aa  240  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>