More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2379 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  100 
 
 		 217 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1927  putative translaldolase  82.03 
 
 		 217 aa  363  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0834254  hitchhiker  0.00000000106475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0561  putative translaldolase  76.96 
 
 		 219 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2213  putative translaldolase  76.96 
 
 		 219 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1224  putative translaldolase  77.42 
 
 		 219 aa  337  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  75.12 
 
 		 217 aa  335  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  72.22 
 
 		 217 aa  330  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1805  putative translaldolase  72.22 
 
 		 217 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1738  putative translaldolase  72.22 
 
 		 217 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1099  putative translaldolase  71.76 
 
 		 217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2499  putative translaldolase  76.5 
 
 		 217 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  72.48 
 
 		 218 aa  318  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  71.3 
 
 		 217 aa  315  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  66.36 
 
 		 217 aa  303  9.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2390  putative translaldolase  69.12 
 
 		 217 aa  298  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1807  putative translaldolase  67.59 
 
 		 216 aa  291  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0106  putative translaldolase  63.43 
 
 		 217 aa  286  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  62.21 
 
 		 217 aa  281  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0219  putative translaldolase  65.9 
 
 		 217 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  61.54 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  60.66 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  59.24 
 
 		 215 aa  267  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  56.94 
 
 		 216 aa  262  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  59.62 
 
 		 217 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  59.13 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  59.13 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  58.65 
 
 		 215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  58.17 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  59.62 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  56.73 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  58.65 
 
 		 214 aa  255  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10763  transaldolase  57.94 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0499  putative translaldolase  58.53 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000254528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  57.69 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  58.17 
 
 		 214 aa  251  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  56.25 
 
 		 214 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  58.65 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0461  putative translaldolase  54.34 
 
 		 220 aa  249  2e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.541779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  56.6 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  58.17 
 
 		 214 aa  248  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  54.76 
 
 		 217 aa  246  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  55.09 
 
 		 226 aa  247  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  55.29 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0575  putative translaldolase  53.88 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.267476  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  55.77 
 
 		 214 aa  245  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  54.33 
 
 		 216 aa  245  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4567  putative translaldolase  54.67 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0244923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2002  putative translaldolase  54.67 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  55.77 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  56.6 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  56.73 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  56.73 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  56.73 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  56.73 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  56.73 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  56.73 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  56.73 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  56.73 
 
 		 215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  55.19 
 
 		 221 aa  241  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  56.25 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  55.5 
 
 		 213 aa  241  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  54.63 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  55.77 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2130  putative translaldolase  57.34 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  54.98 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  55.77 
 
 		 219 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  55.4 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  52.38 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  52.38 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3027  transaldolase  52.27 
 
 		 221 aa  238  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1679  putative translaldolase  57.94 
 
 		 216 aa  238  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0859  transaldolase  54.81 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  53.74 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  56.07 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  56.73 
 
 		 217 aa  238  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  53.11 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  53.24 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  54.81 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  55.29 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  55.29 
 
 		 216 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  54.07 
 
 		 226 aa  234  7e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1361  transaldolase  52.78 
 
 		 216 aa  234  8e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0166838  normal  0.338675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0348  transaldolase  54.34 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  55.71 
 
 		 221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2875  putative translaldolase  53.24 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  52.88 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_002978  WD0551  putative translaldolase  54.72 
 
 		 213 aa  231  5e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.195885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2476  putative translaldolase  50.93 
 
 		 223 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  52.4 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  51.9 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  50.47 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  51.44 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  55.4 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  52.88 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2403  putative translaldolase  55.29 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  50.96 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  51.89 
 
 		 218 aa  225  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  53.74 
 
 		 220 aa  224  7e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  50.47 
 
 		 215 aa  222  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  50.7 
 
 		 219 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>