More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2625 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00113  pyruvate dehydrogenase subunit E1  72.82 
 
 		 887 aa  1382    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.162586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3488  2-oxo-acid dehydrogenase E1 subunit, homodimeric type  72.82 
 
 		 887 aa  1382    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000010003  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1634  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  53.43 
 
 		 907 aa  967    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000003166  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0512  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  53.43 
 
 		 907 aa  967    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000699469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0339  pyruvate dehydrogenase subunit E1  59.39 
 
 		 881 aa  1090    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3000  pyruvate dehydrogenase subunit E1  57.64 
 
 		 895 aa  1056    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.685258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1600  pyruvate dehydrogenase subunit E1  59.48 
 
 		 896 aa  1077    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160826  normal  0.690435 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4808  pyruvate dehydrogenase subunit E1  63.99 
 
 		 893 aa  1184    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1842  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  53.43 
 
 		 907 aa  967    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.0000000223069  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0424  pyruvate dehydrogenase subunit E1  67 
 
 		 888 aa  1271    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3860  pyruvate dehydrogenase, E1 component  56.56 
 
 		 889 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1502  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.76 
 
 		 891 aa  1059    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5005  pyruvate dehydrogenase, E1 component  59.5 
 
 		 881 aa  1094    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1721  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.76 
 
 		 898 aa  1060    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.630674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1737  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  53.43 
 
 		 907 aa  967    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000212328  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1461  pyruvate dehydrogenase subunit E1  57.98 
 
 		 887 aa  1073    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1522  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.1 
 
 		 887 aa  1076    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0518  pyruvate dehydrogenase subunit E1  59.62 
 
 		 881 aa  1095    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2128  pyruvate dehydrogenase subunit E1  59.11 
 
 		 909 aa  1092    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00934481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1625  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  56.67 
 
 		 889 aa  1044    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1328  pyruvate dehydrogenase subunit E1  55.75 
 
 		 937 aa  1040    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.028663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0442  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.6 
 
 		 891 aa  1076    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000082511  normal  0.261896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1303  pyruvate dehydrogenase subunit E1  59.14 
 
 		 895 aa  1091    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4683  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  59.19 
 
 		 891 aa  1090    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2746  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.76 
 
 		 898 aa  1060    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0783  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  53.43 
 
 		 907 aa  968    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0000178151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1254  pyruvate dehydrogenase subunit E1  53.45 
 
 		 891 aa  981    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3373  pyruvate dehydrogenase subunit E1  53.37 
 
 		 912 aa  959    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0463  pyruvate dehydrogenase subunit E1  60.27 
 
 		 881 aa  1100    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3913  pyruvate dehydrogenase subunit E1  67.12 
 
 		 888 aa  1273    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5443  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.2 
 
 		 898 aa  1061    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1007  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  57.67 
 
 		 897 aa  1075    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194825  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3431  pyruvate dehydrogenase subunit E1  67.42 
 
 		 888 aa  1274    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.771222 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2324  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  53.43 
 
 		 907 aa  968    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1001  pyruvate dehydrogenase subunit E1  57.24 
 
 		 886 aa  1065    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00011508  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3373  pyruvate dehydrogenase subunit E1  53.01 
 
 		 924 aa  929    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0358  pyruvate dehydrogenase subunit E1  59.91 
 
 		 889 aa  1106    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2230  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.76 
 
 		 891 aa  1059    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768184  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0670  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  52.28 
 
 		 916 aa  947    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000792343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1864  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.43 
 
 		 898 aa  1062    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2130  pyruvate dehydrogenase subunit E1  56.22 
 
 		 885 aa  1041    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0874  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  52.68 
 
 		 891 aa  946    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3057  pyruvate dehydrogenase subunit E1  50.33 
 
 		 945 aa  922    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1551  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  50.7 
 
 		 879 aa  874    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2212  pyruvate dehydrogenase subunit E1  57.29 
 
 		 903 aa  1083    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00159714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3650  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  50.34 
 
 		 875 aa  858    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2573  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.74 
 
 		 884 aa  1105    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.207684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3090  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.76 
 
 		 891 aa  1059    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00640831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2074  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.91 
 
 		 884 aa  1098    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2672  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.09 
 
 		 913 aa  1085    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000588589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3831  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  51.93 
 
 		 900 aa  875    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1541  pyruvate dehydrogenase subunit E1  59.01 
 
 		 898 aa  1071    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.0677375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4472  pyruvate dehydrogenase subunit E1  54.6 
 
 		 913 aa  974    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150993 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1063  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  54.2 
 
 		 906 aa  969    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3383  pyruvate dehydrogenase subunit E1  85.52 
 
 		 886 aa  1601    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.771869  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0734  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.22 
 
 		 898 aa  1066    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00461526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0855  pyruvate dehydrogenase subunit E1  54.85 
 
 		 896 aa  976    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1050  pyruvate dehydrogenase subunit E1  56.61 
 
 		 937 aa  1043    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.349396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1196  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.92 
 
 		 895 aa  1079    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.737897  normal  0.868931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4263  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  58.29 
 
 		 892 aa  1070    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0512  pyruvate dehydrogenase subunit E1  65.84 
 
 		 889 aa  1256    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0724588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2667  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.76 
 
 		 890 aa  1058    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2792  pyruvate dehydrogenase subunit E1  51.75 
 
 		 893 aa  939    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1887  pyruvate dehydrogenase subunit E1  49.78 
 
 		 902 aa  886    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2781  pyruvate dehydrogenase subunit E1  52.47 
 
 		 929 aa  940    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4918  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  52.49 
 
 		 904 aa  954    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5940  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.2 
 
 		 898 aa  1063    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3362  pyruvate dehydrogenase subunit E1  53.01 
 
 		 924 aa  929    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00342151  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1919  pyruvate dehydrogenase subunit E1  57.53 
 
 		 902 aa  1098    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.0960769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1115  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  51.29 
 
 		 899 aa  931    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3350  pyruvate dehydrogenase subunit E1  66.11 
 
 		 890 aa  1237    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2462  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  53.43 
 
 		 907 aa  967    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000385423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2612  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.65 
 
 		 890 aa  1058    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1095  pyruvate dehydrogenase subunit E1  71.09 
 
 		 887 aa  1375    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.159185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0428  pyruvate dehydrogenase subunit E1  67 
 
 		 888 aa  1270    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.753679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3599  pyruvate dehydrogenase subunit E1  67 
 
 		 888 aa  1270    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0269  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.65 
 
 		 895 aa  1052    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.818226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3777  pyruvate dehydrogenase subunit E1  66.67 
 
 		 888 aa  1261    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2174  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.2 
 
 		 898 aa  1063    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6501  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  52.95 
 
 		 904 aa  961    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66290  pyruvate dehydrogenase subunit E1  60.18 
 
 		 882 aa  1104    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1037  pyruvate dehydrogenase subunit E1  56.18 
 
 		 891 aa  1023    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2464  pyruvate dehydrogenase subunit E1  50.85 
 
 		 922 aa  900    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3414  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  50 
 
 		 922 aa  901    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2137  pyruvate dehydrogenase subunit E1  58.2 
 
 		 898 aa  1063    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3245  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  52.61 
 
 		 904 aa  956    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.633638  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2125  pyruvate dehydrogenase subunit E1  59.89 
 
 		 898 aa  1132    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0558604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0426  pyruvate dehydrogenase subunit E1  67.23 
 
 		 888 aa  1271    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.373094  normal  0.0838359 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4858  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  51.13 
 
 		 906 aa  899    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0734587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1993  pyruvate dehydrogenase subunit E1  50.73 
 
 		 932 aa  889    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.883092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2105  pyruvate dehydrogenase subunit E1  47.26 
 
 		 892 aa  750    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00865423  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0375  pyruvate dehydrogenase subunit E1  84.77 
 
 		 898 aa  1570    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106725 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3424  pyruvate dehydrogenase subunit E1  53.01 
 
 		 929 aa  929    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2927  pyruvate dehydrogenase subunit E1  81.96 
 
 		 886 aa  1528    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0320949  normal  0.180637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3752  pyruvate dehydrogenase subunit E1  52.87 
 
 		 924 aa  950    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0660504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3328  pyruvate dehydrogenase subunit E1  56.39 
 
 		 887 aa  1045    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.973498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2462  pyruvate dehydrogenase subunit E1  59.24 
 
 		 907 aa  1099    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0130543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4757  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  51.25 
 
 		 915 aa  872    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1781  pyruvate dehydrogenase subunit E1  57.43 
 
 		 909 aa  1079    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000127285  decreased coverage  0.000322845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1617  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  52.6 
 
 		 905 aa  879    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.743799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>