95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05391 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05391  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  433  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001455  thiol-disulfide isomerase  80.95 
 
 		 210 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0701  putative lipoprotein  51.52 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.89 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.51 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.46 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.88 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  25.69 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.08 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.17 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.17 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.17 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.17 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.17 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.13 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  26.32 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  25.86 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  27.14 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0433  disulfide isomerase  28.18 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.529354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.68 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.8 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.76 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  28.41 
 
 		 249 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.49 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.49 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  32 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.49 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.49 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.49 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.49 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.32 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.49 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  24.43 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  27.49 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  25.78 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.62 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.72 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.65 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  25.36 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.8 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  24.65 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  26.07 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  25 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  24.53 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  25.79 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  24.4 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.44 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  26.94 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.63 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.26 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  27.66 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  25 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  21.82 
 
 		 210 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.76 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>