55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001455 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001455  thiol-disulfide isomerase  100 
 
 
210 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05391  hypothetical protein  80.95 
 
 
210 aa  355  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0701  putative lipoprotein  48.56 
 
 
207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.06 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.17 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 
250 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 
250 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 
251 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 
250 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  25.82 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.66 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.49 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  26.85 
 
 
249 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  24.06 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  25.58 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  25.24 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.91 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.93 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  23.85 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.24 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 
203 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  25 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  25 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  25 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  25 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  25 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 
218 aa  45.1  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.56 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.04 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  23.5 
 
 
218 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  22.02 
 
 
218 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  24.87 
 
 
293 aa  42  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  28.82 
 
 
206 aa  42  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 
206 aa  41.6  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  23.44 
 
 
200 aa  41.2  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 
203 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 
203 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>