71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0701 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0701  putative lipoprotein  100 
 
 		 207 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05391  hypothetical protein  51.58 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001455  thiol-disulfide isomerase  48.56 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  26.27 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.74 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  25.6 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  27.47 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  26.58 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.89 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  23.26 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.96 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  26.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.46 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.79 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  27.87 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  24.52 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  24.43 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  27.43 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  27.98 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  23.26 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  26.01 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  27.96 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  22.33 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  23.91 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  24.43 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.88 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.06 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.64 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.22 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  24.6 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.59 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.37 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  24.41 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  23.22 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.42 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 		 275 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.65 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.65 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.65 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.65 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.65 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  24.52 
 
 		 206 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  24.52 
 
 		 206 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.18 
 
 		 202 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.68 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.19 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 		 250 aa  41.2  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>