More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0701 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
305 aa  596  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  42.81 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
299 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
342 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
307 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 
306 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.14 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.14 
 
 
307 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
285 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  39.78 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
300 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
300 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.79 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
296 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  39.79 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  39.79 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.79 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717145 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
300 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  37.63 
 
 
302 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
303 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3878  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.14 
 
 
305 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
303 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  37.63 
 
 
302 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
302 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 
300 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
313 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
343 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
294 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
323 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145081  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0003  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.06 
 
 
313 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158402  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
310 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
280 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 
300 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  35.86 
 
 
300 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
344 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.63 
 
 
289 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 
316 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  36.16 
 
 
299 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
280 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
282 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
310 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 
304 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  38.57 
 
 
304 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0117  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  42.09 
 
 
300 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697818  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
294 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
300 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
293 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
867 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  35.53 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  35.45 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
303 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
299 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
301 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
299 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
327 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1251  putative oligopeptide transport system permease protein  42.29 
 
 
300 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  36.93 
 
 
300 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
285 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3017  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.29 
 
 
300 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2901  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.29 
 
 
300 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00914111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
301 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  37.06 
 
 
297 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2217  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 
300 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 
296 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284812 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  38.46 
 
 
288 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
289 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
291 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
299 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1536  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.29 
 
 
300 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
468 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2680  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.72 
 
 
290 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129024  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
304 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
297 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
297 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
297 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0353  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.29 
 
 
300 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
280 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0387  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.29 
 
 
300 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.510408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1726  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.29 
 
 
300 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
321 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
308 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  36.52 
 
 
303 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>