51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0299 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0299  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
387 aa  784    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0363  glycosyl transferase, group 1  43.05 
 
 
383 aa  223  6e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0389  hypothetical protein  50.51 
 
 
244 aa  207  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380665  normal  0.0164926 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1066  hypothetical protein  30.67 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0523  anthranilate synthase, component I  26.51 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  31.16 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
406 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  21.19 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  21.19 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  33.04 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.58 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
415 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.6 
 
 
394 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
402 aa  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  26.39 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2282  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  27.14 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
904 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.14 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.14 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
380 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  29.13 
 
 
390 aa  47.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  27.84 
 
 
363 aa  47  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
476 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 
386 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  27.81 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.23 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0724  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0188295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
364 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
392 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
575 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
350 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
399 aa  43.5  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3655  glycosyl transferase, group 1  48.78 
 
 
442 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
475 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  23.85 
 
 
564 aa  43.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
345 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  23.91 
 
 
408 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>