25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0523 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0523  anthranilate synthase, component I  100 
 
 
359 aa  731    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0389  hypothetical protein  28.81 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380665  normal  0.0164926 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0363  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0299  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  22.08 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  25.53 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  22.09 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  20.92 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
390 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.22 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
475 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  19.86 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  17.76 
 
 
412 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.18 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  23.89 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  24.26 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
390 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.31 
 
 
394 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
398 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  21.14 
 
 
360 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
415 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>