23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0363 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0363  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
383 aa  765    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0299  glycosyl transferase, group 1  43.05 
 
 
387 aa  223  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0389  hypothetical protein  50.22 
 
 
244 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380665  normal  0.0164926 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1066  hypothetical protein  37.22 
 
 
371 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0523  anthranilate synthase, component I  25.43 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  21.26 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
386 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  25 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2282  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
386 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  25.99 
 
 
366 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  29.25 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
445 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  23.65 
 
 
419 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  27.11 
 
 
350 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 
394 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>