266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0244 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0244  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  228  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0542  hypothetical protein  69.64 
 
 
111 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1446  hypothetical protein  47.86 
 
 
128 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0981  hypothetical protein  42.74 
 
 
119 aa  92  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  45.45 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  35.35 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  38.32 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  40.19 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.59 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  34.34 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  35.51 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  34.34 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  35.4 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  38.24 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  35.05 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  34.38 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  34.38 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  40.38 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  35.85 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  34 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  41.35 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  31.25 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  35.85 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  35.85 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  32.32 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  39.42 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  34.34 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  37.25 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  35.35 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  40.38 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  35.58 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  38.3 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  35.35 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  28.42 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  30.43 
 
 
120 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  34.34 
 
 
104 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  36.27 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  26.04 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  36.36 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  36.27 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  31.37 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  34.88 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  34.58 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1671  hypothetical protein  34 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  31.25 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  32.43 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  34.04 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  31.25 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  34.07 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  31.46 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  36.27 
 
 
108 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  34.48 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  30.21 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  33.67 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  34 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  32.67 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  30.93 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  35.56 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  31.25 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0831  hypothetical protein  39.77 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  30.3 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  32.97 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  29.9 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  30.3 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  30.3 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  32.08 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  31.25 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  31.25 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  30.61 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  28.12 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0817  hypothetical protein  31.82 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  29.17 
 
 
109 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0113  hypothetical protein  36.84 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00102828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  34 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  30.69 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  29.91 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>