43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0981 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0981  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  241  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0542  hypothetical protein  47.9 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0244  hypothetical protein  45.92 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1446  hypothetical protein  39.32 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  27.47 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  30.59 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  30.59 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  24.47 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  30.77 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  30.11 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  27.17 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  27.71 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  27.47 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  30.61 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  27.17 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  27.17 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1633  hypothetical protein  25 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1814  hypothetical protein  25 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.888955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  28.26 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  26.32 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2002  hypothetical protein  23.96 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  26.32 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  26.32 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  29.73 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  29.67 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  25.58 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  26.32 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  26.44 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  28.87 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0335  hypothetical protein  25.77 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  21.28 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0793  hypothetical protein  31.65 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0257165  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2555  hypothetical protein  28.74 
 
 
106 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  26.44 
 
 
108 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0799  hypothetical protein  31.25 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283933  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  28.05 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  27.27 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  25 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  27.84 
 
 
109 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  24.24 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  28.74 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  25.56 
 
 
109 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>