259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0542 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  215  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0244  hypothetical protein  69.64 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0981  hypothetical protein  47.9 
 
 		 119 aa  103  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1446  hypothetical protein  44.92 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  38.04 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  34 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  37.11 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  38.2 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  34.74 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  36.63 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  32.97 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  34.91 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  35.87 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  36.46 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  34.04 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  34.95 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  34.34 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  35.64 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  34.34 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  34.74 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  35.64 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2555  hypothetical protein  36.47 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  34.34 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  31.37 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  36 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  35.42 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  33.68 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  33.68 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  34.38 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  33.02 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  34.65 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  33.01 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  33.01 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  32.14 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  28.57 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0831  hypothetical protein  41.86 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  34.44 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  35.42 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  34.69 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  37.93 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  29.13 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  34.91 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  36.78 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  36.78 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  34.91 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  33.66 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  35.58 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  32.35 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  35.79 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  34.41 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  30.39 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  25 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0056  hypothetical protein  32 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0233417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  31.68 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  30.69 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  30.1 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  30.77 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  31.13 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1671  hypothetical protein  35.63 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  31 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  32.18 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  30.69 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  33.68 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  34.29 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  34.29 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  34.29 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  36.78 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  32.67 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  32.69 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  30.85 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  33.68 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  32.67 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  32.67 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  30.21 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  33.66 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  31.91 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  33.01 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  31.68 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>