292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0831 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0831  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  204  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  39.39 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2555  hypothetical protein  37.76 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  37.96 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08096  hypothetical protein  40.95 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  36.36 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  38.38 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  38.78 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  39.39 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  37.37 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  39.22 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  41.18 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  40.4 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  40.4 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  38.38 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  38.38 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  37.25 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  36.36 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  39.39 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  40.4 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  35.29 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  37.76 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  38 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  37.76 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  38.78 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  37.76 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  39.58 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  37.36 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  29.79 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  38.38 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  35.05 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  37.5 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  38.38 
 
 
109 aa  67  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  37.37 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  35.42 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  38.54 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  35.35 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  35.05 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  39.58 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  37.37 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  37.37 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  34.34 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  39.78 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  37.63 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  40.19 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  42 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  35.35 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  37.86 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  37.86 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  31.31 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  37.5 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  34.02 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  34.34 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  32.99 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  38.83 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  36.36 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  39.22 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  36.36 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  36.36 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  38.83 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  32.99 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  36.46 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>