162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08096 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08096  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2555  hypothetical protein  71.43 
 
 		 106 aa  152  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0831  hypothetical protein  43.16 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  34.58 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  32.67 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1671  hypothetical protein  33.66 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  29.52 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  33.66 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  28.57 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  33.65 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  32.67 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  30.69 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  30.91 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  34.91 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  30.28 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  30.28 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  31.13 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  30.39 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  30.28 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  31.13 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  29.25 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  28.85 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  31.37 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  29.81 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  28.85 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  28.85 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  29.81 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  30.91 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  30.28 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  28.85 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  32.67 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  32.67 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  25.24 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  29.29 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  30 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  26.92 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  30.84 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  30.84 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  26.92 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  27.36 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  27.36 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  30.39 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  26.92 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  29.25 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  27.1 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  26.92 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  34.29 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  26.92 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  26.92 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  26.92 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  27.36 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  27.36 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  27.36 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  27.36 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  27.36 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  27.1 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  31.19 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  26.92 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  30.77 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  30.77 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0797  hypothetical protein  38.27 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.891602  normal  0.0353657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  36.27 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  31.43 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  32.94 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  35.29 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  30.28 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  30.1 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  32.22 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  30.53 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  27.84 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  28.71 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0799  hypothetical protein  31.96 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  25.96 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  31.19 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  27.45 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  25.96 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  33.03 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  33.65 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4212  hypothetical protein  35.56 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  28.85 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  27.88 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  31.19 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  34.86 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  33.65 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  28.43 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>