239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0113 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0113  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00102828  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1814  hypothetical protein  72.73 
 
 		 103 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.888955  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1633  hypothetical protein  72.73 
 
 		 103 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2002  hypothetical protein  71.72 
 
 		 103 aa  142  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0073  hypothetical protein  69.7 
 
 		 105 aa  137  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000870053  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1738  hypothetical protein  65.31 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00982484  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0066  hypothetical protein  62.63 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1936  hypothetical protein  61.62 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0200  hypothetical protein  49.5 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0335  hypothetical protein  54.74 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  41.94 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  45.78 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  38.1 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  39.78 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  37.63 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  39.02 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  39.02 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  39.02 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  34.41 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  37.8 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  37.8 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  37.63 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  37.63 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  37.63 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  37.63 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  37.63 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  37.63 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  37.63 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  37.63 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  36.56 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  36.56 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  35.48 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  36.56 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  36.56 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  35.48 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  36.56 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  39.19 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  36.56 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  35.48 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  35.29 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  39.29 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  35.29 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  35.29 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  35.29 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  35.71 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  34.41 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  37.8 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  34.88 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  36.05 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  38.37 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  35.48 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  38.82 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  32.32 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  32.98 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  32.63 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0793  hypothetical protein  39.44 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0257165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  38.57 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  34.41 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0244  hypothetical protein  42.67 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  36.56 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  32.89 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  36.73 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  32.26 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  34.41 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  35.11 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  41.03 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1136  hypothetical protein  38.57 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226792  unclonable  0.000000014815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0875  hypothetical protein  34.18 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.477769  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0799  hypothetical protein  39.44 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1366  hypothetical protein  37 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0056  hypothetical protein  43.75 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0233417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3197  hypothetical protein  38.03 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  32.14 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  34.85 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  35.8 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2890  hypothetical protein  38.03 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  32.63 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3058  hypothetical protein  38.03 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  36.67 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  34.21 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  35.37 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>