287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1366 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1366  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  214  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  40.43 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  38.68 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  40.2 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  41.12 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  41.82 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  39.22 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  37.74 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  38.68 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  38.68 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  40.57 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  40.57 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  40.57 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  40.57 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  40.57 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  40.57 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  40.57 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  38.68 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  42.06 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  40.19 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  40.57 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1671  hypothetical protein  40.82 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  40.19 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  39.62 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  41.12 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  37.74 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  36.79 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  36.08 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0793  hypothetical protein  40.18 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0257165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  38.14 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  33.7 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  36.27 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  42.39 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  32.38 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0799  hypothetical protein  40.18 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  35.11 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  39.58 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  39.22 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  32.69 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  40.82 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  38.78 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  36.56 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  36.56 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  40.19 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  36.08 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  35.24 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  35.24 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  39 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  36.17 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  36.17 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  39.6 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  38.24 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  37.89 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  37.89 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  37.89 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  37.62 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  40.74 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  36.27 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  38.68 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  39.78 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  36.17 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0335  hypothetical protein  38.1 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  37.89 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  37.25 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  37.25 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  37.25 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  36.19 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  31.58 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  30.85 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  34.41 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  38.78 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  37.63 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  38.78 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  38.78 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  35.48 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  39.29 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  36.56 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  35.48 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  34.83 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  31.13 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>