211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0073 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0073  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  197  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000870053  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1738  hypothetical protein  75.96 
 
 
104 aa  152  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00982484  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0113  hypothetical protein  69.7 
 
 
101 aa  137  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00102828  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0066  hypothetical protein  68.63 
 
 
103 aa  134  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1814  hypothetical protein  64.65 
 
 
103 aa  126  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.888955  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1633  hypothetical protein  64.65 
 
 
103 aa  126  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2002  hypothetical protein  64.65 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1936  hypothetical protein  59.8 
 
 
105 aa  120  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0200  hypothetical protein  55.88 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0335  hypothetical protein  52.58 
 
 
102 aa  94  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  34 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  43.48 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  41.11 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  38.04 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  39.73 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  35.87 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  31.68 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  38.37 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  34.74 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  34.78 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  34.78 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  33 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  38.3 
 
 
107 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  33.68 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  34 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  33.68 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  33.68 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  29.41 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  31.07 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  34.41 
 
 
111 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  31.52 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  34.41 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  32.67 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  37.37 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  34.78 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  32.95 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  37.37 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  34.41 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  37.37 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  35.11 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0056  hypothetical protein  42.25 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0233417  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1366  hypothetical protein  35.79 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  31 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  41.43 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  36.84 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  36.84 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  34.41 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  28.28 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  34.88 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  36.08 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  39.53 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  39.13 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  32.35 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  35.79 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  34.34 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  33.72 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  35.71 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  32.35 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  37.63 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  31 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0797  hypothetical protein  46.48 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.891602  normal  0.0353657 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  28.72 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  32.26 
 
 
109 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  31.18 
 
 
107 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  34.15 
 
 
108 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  34.25 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  32.26 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  34.34 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  31.18 
 
 
110 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  44.93 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  31.31 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>