243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1936 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1936  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  206  7e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1738  hypothetical protein  60.78 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00982484  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0113  hypothetical protein  61.62 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00102828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0073  hypothetical protein  59.8 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000870053  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0066  hypothetical protein  56.86 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1814  hypothetical protein  57 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.888955  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1633  hypothetical protein  57 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2002  hypothetical protein  56 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0200  hypothetical protein  52.83 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0335  hypothetical protein  52.43 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  52 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  48 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  47.06 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  41.57 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  47.44 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  41.38 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  43.18 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  43.18 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  45.83 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  40.45 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  39.76 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  39.33 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  45.83 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  40.96 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  38.2 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  41.98 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  45.83 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  48.72 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  39.6 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  41.33 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  39.33 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  39.6 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  45.83 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  39.6 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  39.6 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  39.22 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  47.44 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  44.44 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  42.11 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  39.33 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  46.15 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  39.53 
 
 		 109 aa  57  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  39.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  39.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  38.37 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  41.33 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  39.24 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  37.18 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  37.89 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  33.68 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  38.03 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  41.56 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  42.67 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  38.55 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  37.33 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  41.89 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5528  hypothetical protein  44.26 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  37.23 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1366  hypothetical protein  30.91 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  36 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  39.51 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  42.67 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  37.14 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  44.26 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>