243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0066 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0066  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  197  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0073  hypothetical protein  68.63 
 
 
105 aa  134  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000870053  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1738  hypothetical protein  65.05 
 
 
104 aa  130  6.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00982484  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0113  hypothetical protein  62.63 
 
 
101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00102828  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0200  hypothetical protein  57.55 
 
 
108 aa  120  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1936  hypothetical protein  56.86 
 
 
105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1814  hypothetical protein  56.44 
 
 
103 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.888955  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1633  hypothetical protein  56.44 
 
 
103 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2002  hypothetical protein  56.44 
 
 
103 aa  116  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0335  hypothetical protein  47.42 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  38.3 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  37.35 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  34.09 
 
 
104 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  36.9 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  36.9 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  35.87 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  35.63 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  41.67 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  36.56 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  34.41 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  36.56 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  36.56 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  36.56 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  36.56 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  35.48 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  36.56 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  35.29 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  35.48 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  34.94 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  34.48 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  34.48 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  32.67 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  34.48 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  37.11 
 
 
103 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  35.48 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  37.93 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  35.48 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  32.29 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  32.14 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  35.87 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  35.48 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  34.41 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  35.48 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  31.52 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  35.48 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  32.98 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  34.41 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  34.41 
 
 
110 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  31.91 
 
 
107 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  33.03 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  30.21 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  31.25 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  35.9 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  28.04 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  34.04 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  34.04 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  33.72 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  36.96 
 
 
112 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  30.3 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  36.14 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0875  hypothetical protein  29.17 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.477769  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  30.53 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  39.39 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  30.85 
 
 
103 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  30.3 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  30.85 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  29.41 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  34.78 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  37.5 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  34.94 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1974  hypothetical protein  36.62 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178453  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  31.03 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>