52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1772 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1772  THUMP domain-containing protein  100 
 
 		 369 aa  730    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.375193  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1622  THUMP domain-containing protein  43.06 
 
 		 364 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.92065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0539  THUMP domain-containing protein  42 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0117648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1812  THUMP domain-containing protein  41.71 
 
 		 360 aa  252  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1655  THUMP domain-containing protein  41.6 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.57853  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  52.78 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.54 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  46.03 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.54 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1371  putative RNA methylase  34.19 
 
 		 408 aa  52.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  42.86 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.89 
 
 		 484 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.65 
 
 		 484 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.16 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.64 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.39 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.25 
 
 		 482 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  26.71 
 
 		 484 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  26.71 
 
 		 484 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  26.71 
 
 		 484 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  37.35 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  47.27 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.27 
 
 		 484 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.35 
 
 		 484 aa  46.2  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.67 
 
 		 484 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  35.44 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.6 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.6 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.6 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.58 
 
 		 483 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  26.36 
 
 		 484 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  28.1 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 484 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 484 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  31.75 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.18 
 
 		 484 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.48 
 
 		 484 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4304  THUMP domain-containing protein  28.95 
 
 		 354 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.27 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.96 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  36.84 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.6 
 
 		 484 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 482 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 482 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 		 482 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>