41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1755 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1755  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
305 aa  592  1e-168  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.882145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  33.57 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 
461 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  30.72 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  25.47 
 
 
334 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  24.87 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  30.94 
 
 
319 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  27.38 
 
 
316 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  28.05 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.42 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  25.23 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  31.3 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 
338 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  29.03 
 
 
3027 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  21.59 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  30.46 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  24.31 
 
 
359 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  31.09 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28 
 
 
592 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  30.07 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  27.06 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
693 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  27.13 
 
 
679 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
653 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
651 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  35.56 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.14 
 
 
619 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  29.29 
 
 
332 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  43.14 
 
 
354 aa  43.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  28.1 
 
 
335 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  25.15 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  24.15 
 
 
345 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
690 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  28 
 
 
339 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>