136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1032 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1032  condensation domain protein  100 
 
 
486 aa  988    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1833  condensation domain protein  46.93 
 
 
496 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11206  polyketide synthase associated protein papA3  26.27 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3178  condensation domain-containing protein  25.89 
 
 
488 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268597  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3129  condensation domain-containing protein  25.89 
 
 
488 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3118  condensation domain-containing protein  25.89 
 
 
518 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13854  polyketide synthase associated protein papA2  24.74 
 
 
468 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13858  polyketide synthase associated protein papA1  24.53 
 
 
511 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3562  condensation domain protein  25.83 
 
 
436 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0270  condensation domain-containing protein  22.95 
 
 
473 aa  101  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0404  condensation domain-containing protein  23.27 
 
 
473 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0297  condensation domain protein  22.87 
 
 
492 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0410  condensation domain protein  22.72 
 
 
474 aa  93.6  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100508  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0245  PapA3_1  23.06 
 
 
473 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0255  PapA3_1  23.06 
 
 
473 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100826  decreased coverage  0.00393539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0235  PapA3_1  23.06 
 
 
473 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  22.85 
 
 
601 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189301  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  22.12 
 
 
2997 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  25.07 
 
 
7785 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4486  amino acid adenylation domain protein  26.53 
 
 
1691 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  19.47 
 
 
1449 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5089  Aspartate racemase  32.61 
 
 
856 aa  57  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  23.36 
 
 
1142 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  24.79 
 
 
3352 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.88 
 
 
1876 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  24.51 
 
 
3328 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  24.51 
 
 
6081 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  23.45 
 
 
3498 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  24.51 
 
 
6072 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  24.51 
 
 
6006 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  24.93 
 
 
2350 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  23.24 
 
 
2201 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  22.51 
 
 
3942 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  23.95 
 
 
3308 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  22.49 
 
 
2033 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  26.34 
 
 
1587 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  23.55 
 
 
7310 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3345  non-ribosomal peptide synthetase  33.33 
 
 
1059 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  22.75 
 
 
7168 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  23.03 
 
 
3432 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  22.3 
 
 
3374 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  24.04 
 
 
2581 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  27.61 
 
 
3395 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4498  amino acid adenylation domain protein  24.84 
 
 
1892 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.693218  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  26.42 
 
 
3176 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0191  amino acid adenylation domain-containing protein  22.1 
 
 
1071 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  24.22 
 
 
1363 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  27.23 
 
 
3404 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  26.57 
 
 
1083 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  23.23 
 
 
1146 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  29.21 
 
 
1726 aa  50.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  25.86 
 
 
3695 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5162  condensation domain protein  28 
 
 
843 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  26.17 
 
 
3710 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1746  amino acid adenylation domain protein  25.98 
 
 
3532 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000653127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  22.65 
 
 
4502 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  25.22 
 
 
1745 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  25.22 
 
 
1745 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  25.8 
 
 
1745 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  22.8 
 
 
1870 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  22.8 
 
 
1870 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  32.87 
 
 
2625 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3410  erythronolide synthase, Aspartate racemase  28.57 
 
 
1781 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0828019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  24.86 
 
 
2614 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  23.53 
 
 
3235 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  23.18 
 
 
5953 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  28.41 
 
 
1383 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  21.88 
 
 
1914 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4624  aspartate racemase  31.71 
 
 
856 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0240393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  22.94 
 
 
9175 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  25.72 
 
 
2412 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  22.91 
 
 
3470 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.58 
 
 
6403 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  27.27 
 
 
2571 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  29.21 
 
 
2137 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  27.27 
 
 
2571 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  30.13 
 
 
7712 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1704  amino acid adenylation  22.68 
 
 
1322 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.410435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  23.08 
 
 
2386 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  22.01 
 
 
3021 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  25.99 
 
 
3739 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  21.22 
 
 
1104 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  23.78 
 
 
5738 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  25.31 
 
 
2365 aa  47  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  22.13 
 
 
2752 aa  47  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  24.23 
 
 
2151 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  20.18 
 
 
2875 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  22.6 
 
 
2448 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  31.29 
 
 
2155 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  26.79 
 
 
7214 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  23.72 
 
 
13537 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  27.35 
 
 
2596 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2091  amino acid adenylation domain-containing protein  23.62 
 
 
1145 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  24.25 
 
 
4317 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  24.21 
 
 
5750 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  22.46 
 
 
2154 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  26.67 
 
 
1369 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  23.42 
 
 
4882 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  24.48 
 
 
1356 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0965  amino acid adenylation domain protein  21.85 
 
 
1506 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>