More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5089 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5089  Aspartate racemase  100 
 
 
856 aa  1680    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5162  condensation domain protein  80.21 
 
 
843 aa  1295    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4624  aspartate racemase  97.78 
 
 
856 aa  1580    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0240393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  36.84 
 
 
1375 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1246  condensation domain protein  35.48 
 
 
938 aa  263  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2581  condensation domain-containing protein  32.68 
 
 
935 aa  252  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  30.27 
 
 
9498 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0847  condensation domain-containing protein  33.49 
 
 
940 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.369359  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  36.19 
 
 
3498 aa  245  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  35.29 
 
 
6661 aa  245  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  37.92 
 
 
1109 aa  237  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  36.3 
 
 
2201 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  36.79 
 
 
1369 aa  230  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  30.95 
 
 
2395 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  30.95 
 
 
2395 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.02 
 
 
3432 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  38.65 
 
 
2137 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  22.61 
 
 
1449 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  34.43 
 
 
2867 aa  223  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  35.71 
 
 
7712 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  33.49 
 
 
5738 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  30.26 
 
 
2156 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  30.95 
 
 
3824 aa  221  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  30.95 
 
 
2664 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  31.74 
 
 
1193 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  31.74 
 
 
1193 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  27.25 
 
 
2054 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  38 
 
 
2350 aa  220  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  34.81 
 
 
2448 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.39 
 
 
4968 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  33.57 
 
 
2033 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.48 
 
 
3308 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.93 
 
 
1876 aa  218  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  28.74 
 
 
2156 aa  218  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.27 
 
 
6403 aa  218  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  33.96 
 
 
2189 aa  217  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  28.9 
 
 
2156 aa  217  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  30.18 
 
 
1556 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  31.12 
 
 
4960 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.65 
 
 
3291 aa  215  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  36.99 
 
 
4318 aa  215  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  31.37 
 
 
4960 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  37.8 
 
 
4336 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  30.17 
 
 
2193 aa  214  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  34.63 
 
 
1356 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  30.02 
 
 
1556 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  35.83 
 
 
1370 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  31.23 
 
 
2752 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  38.21 
 
 
4317 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  35.12 
 
 
3231 aa  211  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  32.67 
 
 
1363 aa  211  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  30.58 
 
 
1146 aa  211  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.79 
 
 
4342 aa  210  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.21 
 
 
1870 aa  211  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.21 
 
 
1870 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  37.21 
 
 
2125 aa  210  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  39.66 
 
 
1138 aa  210  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  37.8 
 
 
4336 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  35.7 
 
 
1137 aa  210  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  39.66 
 
 
4037 aa  210  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  30.82 
 
 
2006 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  32.33 
 
 
4342 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  34.88 
 
 
3942 aa  208  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  36.47 
 
 
5230 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2107  condensation domain-containing protein  33.73 
 
 
504 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32 
 
 
7168 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  39.31 
 
 
3331 aa  206  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  35.87 
 
 
2333 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  35.03 
 
 
3639 aa  206  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  37.91 
 
 
4317 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  29.58 
 
 
1578 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  37.01 
 
 
4317 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.01 
 
 
4317 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  35.78 
 
 
2626 aa  204  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  33.63 
 
 
4483 aa  204  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  29.54 
 
 
3235 aa  204  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  35.66 
 
 
4383 aa  204  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  31.32 
 
 
1436 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  35 
 
 
2875 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  36.92 
 
 
3247 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  37.18 
 
 
1119 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  33.43 
 
 
1550 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  35.34 
 
 
5149 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  29.29 
 
 
2997 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  34.35 
 
 
5654 aa  202  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.82 
 
 
1829 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  33.94 
 
 
2151 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.29 
 
 
2883 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  31.95 
 
 
2628 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  31.79 
 
 
6202 aa  201  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  32.79 
 
 
1753 aa  201  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  33.89 
 
 
4747 aa  201  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  35.56 
 
 
4136 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3972  amino acid adenylation domain-containing protein  33.41 
 
 
1126 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.47287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  33.65 
 
 
5213 aa  200  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35.78 
 
 
5328 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  31.82 
 
 
2419 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  31.57 
 
 
4502 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.31 
 
 
4332 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  34.52 
 
 
1129 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>