More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1246 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0847  condensation domain-containing protein  50.05 
 
 
940 aa  865    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.369359  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1246  condensation domain protein  100 
 
 
938 aa  1898    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2581  condensation domain-containing protein  39.25 
 
 
935 aa  611  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  54.59 
 
 
1375 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  35.06 
 
 
1556 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  35.06 
 
 
1556 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  35.31 
 
 
3498 aa  277  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  33.71 
 
 
2395 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  33.71 
 
 
2664 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  30.67 
 
 
2054 aa  266  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  33.71 
 
 
2395 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  33.71 
 
 
3824 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  37.86 
 
 
6661 aa  263  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.63 
 
 
3308 aa  261  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5089  Aspartate racemase  37.38 
 
 
856 aa  259  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  31.42 
 
 
2997 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  34.44 
 
 
2867 aa  257  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5162  condensation domain protein  37.38 
 
 
843 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  33.98 
 
 
2033 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  33.94 
 
 
3639 aa  254  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  32.58 
 
 
3086 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.93 
 
 
3432 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  32.58 
 
 
3086 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  32.49 
 
 
2581 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.77 
 
 
4968 aa  250  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.99 
 
 
3291 aa  250  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3760  condensation domain protein  37.65 
 
 
769 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.14 
 
 
4960 aa  249  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  32.35 
 
 
2193 aa  249  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.65 
 
 
4960 aa  249  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1673  condensation domain-containing protein  33.72 
 
 
776 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.471335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4624  aspartate racemase  37.38 
 
 
856 aa  247  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0240393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.23 
 
 
2571 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  33.64 
 
 
1142 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  31.87 
 
 
3235 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.49 
 
 
4342 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.23 
 
 
2571 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  35.21 
 
 
4383 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  31.72 
 
 
2006 aa  245  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  30.98 
 
 
2156 aa  245  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  36.54 
 
 
1550 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  32.26 
 
 
4342 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  32.88 
 
 
1193 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  32.88 
 
 
1193 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  29.74 
 
 
1689 aa  244  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  32.2 
 
 
1833 aa  243  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.45 
 
 
2156 aa  243  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  30.68 
 
 
2156 aa  242  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  35.16 
 
 
2201 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  33.7 
 
 
4502 aa  241  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  35.1 
 
 
2125 aa  241  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  35.06 
 
 
7712 aa  240  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  33.79 
 
 
1104 aa  240  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  33.74 
 
 
1369 aa  239  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.27 
 
 
3002 aa  237  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  37.92 
 
 
4747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.1 
 
 
2604 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  33.56 
 
 
1104 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  33.56 
 
 
5926 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  30.2 
 
 
2752 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  31.85 
 
 
2385 aa  235  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.29 
 
 
2370 aa  235  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  32.37 
 
 
2012 aa  235  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  32.04 
 
 
1114 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4486  amino acid adenylation domain protein  35.38 
 
 
1691 aa  235  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  34.17 
 
 
2606 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  32.66 
 
 
1569 aa  234  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  35.02 
 
 
5929 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  30.94 
 
 
4332 aa  234  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  35.65 
 
 
3710 aa  234  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.29 
 
 
6889 aa  233  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  33.56 
 
 
3942 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  33.64 
 
 
5654 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  33.11 
 
 
1129 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  33.82 
 
 
3021 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  34.42 
 
 
4317 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  31.28 
 
 
4318 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  33.94 
 
 
2883 aa  232  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  31.95 
 
 
1816 aa  231  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  34.32 
 
 
1574 aa  231  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  31.24 
 
 
1363 aa  230  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  32.21 
 
 
5738 aa  230  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1592  non-ribosomal peptide synthase  35.47 
 
 
1567 aa  230  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  32.8 
 
 
6081 aa  230  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0186  nonribosomal peptide synthetase  35.47 
 
 
1567 aa  230  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  36.49 
 
 
4572 aa  230  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.26 
 
 
1876 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.55 
 
 
5953 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.56 
 
 
2385 aa  229  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  33.64 
 
 
3404 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.19 
 
 
4317 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  29.61 
 
 
1231 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  33.11 
 
 
2385 aa  228  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  33.77 
 
 
5149 aa  229  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.96 
 
 
4317 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.58 
 
 
2385 aa  228  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  35.57 
 
 
8211 aa  228  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  29.61 
 
 
1231 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.7 
 
 
2385 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.7 
 
 
2385 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>