More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3760 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3760  condensation domain protein  100 
 
 		 769 aa  1560    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1673  condensation domain-containing protein  32.93 
 
 		 776 aa  349  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.471335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1246  condensation domain protein  35.9 
 
 		 938 aa  250  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  33.57 
 
 		 1375 aa  237  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0847  condensation domain-containing protein  32.1 
 
 		 940 aa  224  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.369359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2581  condensation domain-containing protein  31.28 
 
 		 935 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5089  Aspartate racemase  31.18 
 
 		 856 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  31.7 
 
 		 2867 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5162  condensation domain protein  31.12 
 
 		 843 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.97 
 
 		 4968 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4624  aspartate racemase  31.18 
 
 		 856 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  28.39 
 
 		 4960 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  28.68 
 
 		 4960 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.55 
 
 		 1870 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.55 
 
 		 1870 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  28.13 
 
 		 2997 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.82 
 
 		 3498 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  26.91 
 
 		 2054 aa  163  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  27.76 
 
 		 2581 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  27.45 
 
 		 2033 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  27.83 
 
 		 1556 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  26.55 
 
 		 1550 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  27.06 
 
 		 5738 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  31.73 
 
 		 3639 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  28.61 
 
 		 1556 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  28.29 
 
 		 1363 aa  154  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  26.84 
 
 		 2156 aa  153  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  23.99 
 
 		 2395 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  27 
 
 		 2193 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  28.92 
 
 		 7712 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.6 
 
 		 3432 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  25.92 
 
 		 2156 aa  151  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  30.16 
 
 		 2155 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  25.22 
 
 		 2156 aa  150  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  30.11 
 
 		 1689 aa  150  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  28.28 
 
 		 2571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  28.28 
 
 		 2571 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  28.6 
 
 		 5230 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  28.46 
 
 		 2125 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  23.77 
 
 		 2395 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  27.59 
 
 		 2573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  32.33 
 
 		 4747 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  27.18 
 
 		 3308 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  24.88 
 
 		 3824 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  28.12 
 
 		 3404 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.5 
 
 		 6676 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  28.39 
 
 		 6661 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  26.45 
 
 		 3291 aa  148  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  24.63 
 
 		 2664 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  30.56 
 
 		 4383 aa  146  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  27.78 
 
 		 2628 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  30.1 
 
 		 13537 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  28.6 
 
 		 1119 aa  145  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.56 
 
 		 2370 aa  145  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  29.06 
 
 		 8211 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.25 
 
 		 1876 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  27.78 
 
 		 1833 aa  144  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  27.55 
 
 		 2606 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  25.93 
 
 		 2006 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  25.24 
 
 		 2138 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  29.76 
 
 		 6403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  30.67 
 
 		 5953 aa  142  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  25.45 
 
 		 9498 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  26.65 
 
 		 3432 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  27.87 
 
 		 5926 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  27.25 
 
 		 2201 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  29.03 
 
 		 1369 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  22.77 
 
 		 1568 aa  141  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  26.76 
 
 		 1193 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  28.32 
 
 		 7122 aa  141  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  26.76 
 
 		 1193 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  30.32 
 
 		 4483 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.79 
 
 		 5149 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  30.98 
 
 		 3247 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  29.06 
 
 		 1104 aa  138  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  31.02 
 
 		 1137 aa  138  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  30.17 
 
 		 2626 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  28.68 
 
 		 4531 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  29.45 
 
 		 1356 aa  137  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  31.31 
 
 		 2106 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  26.08 
 
 		 3235 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  28.84 
 
 		 3227 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  29.18 
 
 		 3962 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  28.64 
 
 		 1370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  28.97 
 
 		 2883 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  29.16 
 
 		 3219 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.75 
 
 		 1829 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  28.34 
 
 		 8646 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  28.83 
 
 		 5213 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.77 
 
 		 6889 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  29.94 
 
 		 2419 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  26.71 
 
 		 2350 aa  135  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3431  amino acid adenylation domain protein  33.44 
 
 		 1813 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  28.38 
 
 		 3221 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  26.43 
 
 		 1142 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  26.51 
 
 		 1436 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  28.9 
 
 		 5929 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  31.45 
 
 		 5372 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.29 
 
 		 8914 aa  134  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  29.31 
 
 		 2333 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>