More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4624 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5162  condensation domain protein  80.21 
 
 		 843 aa  1293    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5089  Aspartate racemase  97.78 
 
 		 856 aa  1599    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4624  aspartate racemase  100 
 
 		 856 aa  1684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  36.6 
 
 		 1375 aa  264  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1246  condensation domain protein  35.76 
 
 		 938 aa  257  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  29.45 
 
 		 9498 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2581  condensation domain-containing protein  32.46 
 
 		 935 aa  248  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0847  condensation domain-containing protein  33.02 
 
 		 940 aa  241  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.369359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  35.32 
 
 		 3498 aa  240  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  34.84 
 
 		 6661 aa  240  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  37.92 
 
 		 1109 aa  237  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  36.07 
 
 		 2201 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  31.19 
 
 		 2395 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  31.19 
 
 		 2395 aa  232  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  36.56 
 
 		 1369 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  22.37 
 
 		 1449 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.71 
 
 		 3432 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  31.19 
 
 		 3824 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  31.19 
 
 		 2664 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.05 
 
 		 2033 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  30.65 
 
 		 1556 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  37.92 
 
 		 2137 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  37.31 
 
 		 2350 aa  219  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  35.02 
 
 		 7712 aa  219  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.96 
 
 		 2867 aa  218  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  33.11 
 
 		 5738 aa  218  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  31.28 
 
 		 1193 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  31.28 
 
 		 1193 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  26.81 
 
 		 2054 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  29.79 
 
 		 2156 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  30.48 
 
 		 1556 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.8 
 
 		 1870 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.66 
 
 		 1870 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  36.3 
 
 		 1370 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.82 
 
 		 6403 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.33 
 
 		 3308 aa  214  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  34.11 
 
 		 2448 aa  214  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.93 
 
 		 1876 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  30.39 
 
 		 1146 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  37.8 
 
 		 4336 aa  212  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  33.26 
 
 		 2189 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  36.99 
 
 		 4318 aa  212  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  28.44 
 
 		 2156 aa  211  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  34.86 
 
 		 1356 aa  211  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  28.27 
 
 		 2156 aa  211  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.92 
 
 		 4968 aa  211  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  36.96 
 
 		 5230 aa  211  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.18 
 
 		 3291 aa  209  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.9 
 
 		 3231 aa  209  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  30.3 
 
 		 2006 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2107  condensation domain-containing protein  33.73 
 
 		 504 aa  208  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  31.23 
 
 		 2752 aa  208  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  32.22 
 
 		 1363 aa  208  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  36.36 
 
 		 2125 aa  207  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  37.5 
 
 		 4336 aa  207  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.4 
 
 		 4960 aa  207  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.79 
 
 		 4342 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  34.41 
 
 		 3639 aa  206  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  30.66 
 
 		 4960 aa  206  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  32.33 
 
 		 4342 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  37.61 
 
 		 4317 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  28.99 
 
 		 1578 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  34.19 
 
 		 3942 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  35.24 
 
 		 1137 aa  205  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32 
 
 		 7168 aa  204  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  29.45 
 
 		 2193 aa  204  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  38.83 
 
 		 1138 aa  204  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  38.83 
 
 		 4037 aa  204  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  35.55 
 
 		 2626 aa  202  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  35.15 
 
 		 2333 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  37.31 
 
 		 4317 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  32.18 
 
 		 2628 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.42 
 
 		 4317 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  31.55 
 
 		 6202 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  33.04 
 
 		 2151 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  35 
 
 		 2875 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  32.23 
 
 		 5596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.42 
 
 		 4317 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  35.47 
 
 		 4468 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.29 
 
 		 2883 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  31.55 
 
 		 1436 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  35.42 
 
 		 4383 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  32.96 
 
 		 1550 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  36.68 
 
 		 3247 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  33.17 
 
 		 5213 aa  198  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  33.88 
 
 		 5654 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  32.75 
 
 		 4483 aa  197  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.72 
 
 		 1829 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  38.15 
 
 		 3331 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  32.01 
 
 		 1689 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  32.79 
 
 		 1753 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  36.31 
 
 		 1119 aa  197  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  34.62 
 
 		 5149 aa  197  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  31.33 
 
 		 4502 aa  197  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  29.3 
 
 		 3235 aa  197  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  28.64 
 
 		 1833 aa  197  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  33.17 
 
 		 4747 aa  197  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  28.81 
 
 		 2997 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  31.82 
 
 		 2419 aa  197  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  35.71 
 
 		 3291 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>