50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3562 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3562  condensation domain protein  100 
 
 		 436 aa  892    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0410  condensation domain protein  52.35 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0297  condensation domain protein  52.35 
 
 		 492 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0404  condensation domain-containing protein  26.74 
 
 		 473 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3118  condensation domain-containing protein  26.47 
 
 		 518 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3129  condensation domain-containing protein  26.47 
 
 		 488 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3178  condensation domain-containing protein  26.47 
 
 		 488 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268597  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0270  condensation domain-containing protein  26.47 
 
 		 473 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0255  PapA3_1  25.86 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100826  decreased coverage  0.00393539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0235  PapA3_1  25.86 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0245  PapA3_1  25.86 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11206  polyketide synthase associated protein papA3  25.96 
 
 		 472 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13854  polyketide synthase associated protein papA2  25.64 
 
 		 468 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1833  condensation domain protein  28.1 
 
 		 496 aa  123  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13858  polyketide synthase associated protein papA1  25.9 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1032  condensation domain protein  25.83 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  27.51 
 
 		 601 aa  76.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  23.43 
 
 		 4354 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  22.29 
 
 		 3453 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.15 
 
 		 1876 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  25.65 
 
 		 3404 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  24.17 
 
 		 7122 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  26.7 
 
 		 1786 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  25.41 
 
 		 3639 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  25.44 
 
 		 3962 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  27.66 
 
 		 1137 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  25.06 
 
 		 2350 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  30.9 
 
 		 2619 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.37 
 
 		 1806 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  22.96 
 
 		 3221 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  22.77 
 
 		 3231 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  22.77 
 
 		 3231 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  24.07 
 
 		 2125 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  25.72 
 
 		 3227 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  21.33 
 
 		 1449 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  25.72 
 
 		 3227 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  22.33 
 
 		 2573 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  20.36 
 
 		 2997 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  25.86 
 
 		 1104 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  23.35 
 
 		 3308 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  21.63 
 
 		 6676 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  20.7 
 
 		 1550 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  25.17 
 
 		 1104 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  22.86 
 
 		 3219 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  21.66 
 
 		 4502 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  26.01 
 
 		 4318 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2721  condensation domain-containing protein  25 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380255  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6836  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  22.35 
 
 		 467 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3433  condensation domain protein  26.5 
 
 		 1094 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  20.23 
 
 		 4531 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>