39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13858 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13858  polyketide synthase associated protein papA1  100 
 
 
511 aa  1056    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11206  polyketide synthase associated protein papA3  55.96 
 
 
472 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13854  polyketide synthase associated protein papA2  53.25 
 
 
468 aa  478  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0404  condensation domain-containing protein  49.79 
 
 
473 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0270  condensation domain-containing protein  50.43 
 
 
473 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3129  condensation domain-containing protein  49.69 
 
 
488 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3118  condensation domain-containing protein  49.69 
 
 
518 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3178  condensation domain-containing protein  49.69 
 
 
488 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268597  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0235  PapA3_1  49.79 
 
 
473 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0245  PapA3_1  49.79 
 
 
473 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0255  PapA3_1  49.79 
 
 
473 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100826  decreased coverage  0.00393539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3562  condensation domain protein  25.85 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1032  condensation domain protein  24.53 
 
 
486 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0297  condensation domain protein  28.23 
 
 
492 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0410  condensation domain protein  28.23 
 
 
474 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1833  condensation domain protein  24.11 
 
 
496 aa  96.3  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  23.56 
 
 
2033 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  20.76 
 
 
3331 aa  50.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  21.14 
 
 
3432 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  24.49 
 
 
4265 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  27.68 
 
 
3498 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  23.55 
 
 
3639 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  21.07 
 
 
7168 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  25.6 
 
 
1449 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  23.42 
 
 
9498 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  20.59 
 
 
4354 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3419  amino acid adenylation domain protein  23.89 
 
 
1872 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  22.73 
 
 
2883 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  24.37 
 
 
3127 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  24.37 
 
 
3133 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  24.24 
 
 
4239 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  23.81 
 
 
4483 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  24.24 
 
 
4265 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  21.67 
 
 
3101 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1674  linear gramicidin synthetase subunit B  23.63 
 
 
1567 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995646  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  25 
 
 
1506 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  22.34 
 
 
13537 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  24.31 
 
 
1137 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  23.89 
 
 
1726 aa  43.5  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>