38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0410 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0297  condensation domain protein  97.9 
 
 		 492 aa  923    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0410  condensation domain protein  100 
 
 		 474 aa  966    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3562  condensation domain protein  52.35 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0404  condensation domain-containing protein  27.58 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3129  condensation domain-containing protein  25.48 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3178  condensation domain-containing protein  25.48 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268597  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3118  condensation domain-containing protein  25.48 
 
 		 518 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0270  condensation domain-containing protein  26.58 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0245  PapA3_1  26.96 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0255  PapA3_1  26.96 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100826  decreased coverage  0.00393539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0235  PapA3_1  26.96 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11206  polyketide synthase associated protein papA3  25.72 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13858  polyketide synthase associated protein papA1  27.97 
 
 		 511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13854  polyketide synthase associated protein papA2  25.64 
 
 		 468 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1833  condensation domain protein  30.25 
 
 		 496 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1032  condensation domain protein  22.52 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 		 601 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3433  condensation domain protein  30.05 
 
 		 1094 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  24.42 
 
 		 6403 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2785  amino acid adenylation domain-containing protein  23.42 
 
 		 1370 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3683  amino acid adenylation domain protein  27.48 
 
 		 1059 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2721  condensation domain-containing protein  23.05 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380255  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3348  non-ribosomal peptide synthetase  22.58 
 
 		 530 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00415757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  21.73 
 
 		 3207 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  27.12 
 
 		 5698 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  22.54 
 
 		 3453 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  20.59 
 
 		 3432 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1677  amino acid adenylation domain protein  25.82 
 
 		 3289 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  24.83 
 
 		 2679 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  25.22 
 
 		 1369 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  22.66 
 
 		 4354 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  24.38 
 
 		 4318 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  26.06 
 
 		 3739 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  23.83 
 
 		 5738 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  19.74 
 
 		 4502 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  27.47 
 
 		 6889 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  26.97 
 
 		 2350 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  23.95 
 
 		 4186 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>