256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1833 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1833  condensation domain protein  100 
 
 
496 aa  1002    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1032  condensation domain protein  46.93 
 
 
486 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3562  condensation domain protein  28.27 
 
 
436 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3178  condensation domain-containing protein  26.54 
 
 
488 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268597  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3129  condensation domain-containing protein  26.54 
 
 
488 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3118  condensation domain-containing protein  26.54 
 
 
518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0297  condensation domain protein  30.25 
 
 
492 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0410  condensation domain protein  30.25 
 
 
474 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11206  polyketide synthase associated protein papA3  25.45 
 
 
472 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0270  condensation domain-containing protein  24.8 
 
 
473 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0404  condensation domain-containing protein  24.1 
 
 
473 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13858  polyketide synthase associated protein papA1  24.63 
 
 
511 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0245  PapA3_1  25.59 
 
 
473 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0255  PapA3_1  25.59 
 
 
473 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100826  decreased coverage  0.00393539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0235  PapA3_1  25.59 
 
 
473 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13854  polyketide synthase associated protein papA2  25.17 
 
 
468 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.23 
 
 
1876 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  25.94 
 
 
1142 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  25.07 
 
 
3021 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6836  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  27.6 
 
 
467 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  26.09 
 
 
6072 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  26.07 
 
 
3498 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  26.75 
 
 
6006 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  23.64 
 
 
5372 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  25.78 
 
 
3352 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  24.02 
 
 
2997 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  25.78 
 
 
3328 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  25.36 
 
 
2137 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  26.43 
 
 
6081 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  23.94 
 
 
5926 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  27.76 
 
 
1104 aa  70.1  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  23.48 
 
 
5929 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  28.16 
 
 
1083 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  22.86 
 
 
1449 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  22.03 
 
 
2664 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  22.03 
 
 
3824 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  24.4 
 
 
3962 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3063  amino acid adenylation domain protein  24.39 
 
 
1570 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  24.75 
 
 
601 aa  67.8  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  24.92 
 
 
2201 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  26.71 
 
 
6889 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  25 
 
 
3432 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  26.13 
 
 
9498 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  27.73 
 
 
5953 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  26.05 
 
 
6676 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 
3639 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3891  amino acid adenylation domain protein  27.94 
 
 
1256 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  26.35 
 
 
13537 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  26.48 
 
 
6403 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  27.85 
 
 
1726 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  25.8 
 
 
3176 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3874  amino acid adenylation domain protein  27.16 
 
 
1665 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0218124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0847  condensation domain-containing protein  22.12 
 
 
940 aa  64.7  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.369359  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  25.87 
 
 
1356 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  24.05 
 
 
3002 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.42 
 
 
1839 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  23.95 
 
 
3308 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  25 
 
 
2164 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4486  amino acid adenylation domain protein  29.73 
 
 
1691 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  26.75 
 
 
4383 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  23.6 
 
 
2448 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  26.84 
 
 
2350 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  26.33 
 
 
1104 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  25.89 
 
 
2370 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  25.16 
 
 
4531 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  22.52 
 
 
2581 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  27.23 
 
 
4318 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  24.18 
 
 
2151 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  26.19 
 
 
2604 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  22.12 
 
 
1870 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  22.12 
 
 
1870 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  22.51 
 
 
2571 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  26.22 
 
 
2666 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  22.51 
 
 
2571 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  25.72 
 
 
4502 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  22.98 
 
 
2189 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.45 
 
 
1829 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  22.46 
 
 
9175 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  24.92 
 
 
2791 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  21.45 
 
 
3470 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  20 
 
 
3086 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  23.13 
 
 
2154 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  24.15 
 
 
2033 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3431  amino acid adenylation domain protein  25.94 
 
 
1813 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  25.31 
 
 
5328 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  22.22 
 
 
4968 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  23.77 
 
 
4186 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  22.33 
 
 
2395 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  24.56 
 
 
3404 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  20 
 
 
3086 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2097  condensation domain-containing protein  25.12 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  22.33 
 
 
2395 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  23.42 
 
 
5738 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  25 
 
 
3231 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  23.64 
 
 
3453 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  27.78 
 
 
1745 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  22.26 
 
 
4354 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  27.78 
 
 
1745 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  21.5 
 
 
3291 aa  57.4  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  21.39 
 
 
2875 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>