20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0255 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0245  PapA3_1  100 
 
 		 473 aa  982    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0255  PapA3_1  100 
 
 		 473 aa  982    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100826  decreased coverage  0.00393539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0270  condensation domain-containing protein  83.93 
 
 		 473 aa  822    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0235  PapA3_1  100 
 
 		 473 aa  982    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0404  condensation domain-containing protein  81.18 
 
 		 473 aa  804    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11206  polyketide synthase associated protein papA3  52.64 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13858  polyketide synthase associated protein papA1  49.79 
 
 		 511 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3118  condensation domain-containing protein  45.11 
 
 		 518 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3129  condensation domain-containing protein  45.11 
 
 		 488 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3178  condensation domain-containing protein  45.11 
 
 		 488 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268597  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13854  polyketide synthase associated protein papA2  46.54 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3562  condensation domain protein  25.86 
 
 		 436 aa  136  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0410  condensation domain protein  26.96 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0297  condensation domain protein  26.78 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1032  condensation domain protein  23.06 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1833  condensation domain protein  25.59 
 
 		 496 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19190  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  22.58 
 
 		 3648 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.349458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  22.29 
 
 		 1668 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  23.67 
 
 		 4106 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  21.6 
 
 		 1638 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>