26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0270 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0245  PapA3_1  83.93 
 
 
473 aa  808    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0255  PapA3_1  83.93 
 
 
473 aa  808    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100826  decreased coverage  0.00393539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0404  condensation domain-containing protein  84.78 
 
 
473 aa  828    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0270  condensation domain-containing protein  100 
 
 
473 aa  981    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0235  PapA3_1  83.93 
 
 
473 aa  808    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11206  polyketide synthase associated protein papA3  55.18 
 
 
472 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13858  polyketide synthase associated protein papA1  50.43 
 
 
511 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3178  condensation domain-containing protein  46.17 
 
 
488 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268597  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3129  condensation domain-containing protein  46.17 
 
 
488 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3118  condensation domain-containing protein  46.17 
 
 
518 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13854  polyketide synthase associated protein papA2  46.32 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0410  condensation domain protein  26.58 
 
 
474 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3562  condensation domain protein  26.47 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0297  condensation domain protein  26.22 
 
 
492 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1032  condensation domain protein  22.95 
 
 
486 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1833  condensation domain protein  24.8 
 
 
496 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19190  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  22.64 
 
 
3648 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.349458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  23.51 
 
 
1093 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  23.31 
 
 
1668 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  23.86 
 
 
601 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  18.98 
 
 
3432 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2721  condensation domain-containing protein  21.53 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380255  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  24.63 
 
 
3639 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  20.87 
 
 
7168 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  19.64 
 
 
6404 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  21.76 
 
 
4483 aa  43.5  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>