33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0404 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0245  PapA3_1  81.18 
 
 
473 aa  790    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0255  PapA3_1  81.18 
 
 
473 aa  790    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100826  decreased coverage  0.00393539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0270  condensation domain-containing protein  84.78 
 
 
473 aa  825    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0235  PapA3_1  81.18 
 
 
473 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0404  condensation domain-containing protein  100 
 
 
473 aa  980    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11206  polyketide synthase associated protein papA3  53.91 
 
 
472 aa  543  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13858  polyketide synthase associated protein papA1  49.79 
 
 
511 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3118  condensation domain-containing protein  45.53 
 
 
518 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3178  condensation domain-containing protein  45.53 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268597  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3129  condensation domain-containing protein  45.53 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13854  polyketide synthase associated protein papA2  46.32 
 
 
468 aa  405  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0410  condensation domain protein  27.58 
 
 
474 aa  146  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0297  condensation domain protein  27.47 
 
 
492 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3562  condensation domain protein  26.74 
 
 
436 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1833  condensation domain protein  24.1 
 
 
496 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1032  condensation domain protein  23.27 
 
 
486 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  25.71 
 
 
1104 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  21.18 
 
 
2679 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  23.89 
 
 
5620 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  22.63 
 
 
601 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189301  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  21.41 
 
 
4968 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  20.85 
 
 
13537 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  20.65 
 
 
2370 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  21.72 
 
 
3331 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  24.85 
 
 
2310 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  24.68 
 
 
4106 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  22.56 
 
 
1093 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  19.83 
 
 
7168 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19190  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  21.77 
 
 
3648 aa  43.9  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.349458 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  20.9 
 
 
5953 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  19.41 
 
 
9498 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  25.56 
 
 
7310 aa  43.5  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  22.51 
 
 
1668 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>