110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3118 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3118  condensation domain-containing protein  100 
 
 		 518 aa  1072    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3178  condensation domain-containing protein  100 
 
 		 488 aa  1012    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268597  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3129  condensation domain-containing protein  100 
 
 		 488 aa  1012    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11206  polyketide synthase associated protein papA3  53.25 
 
 		 472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13854  polyketide synthase associated protein papA2  55.58 
 
 		 468 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13858  polyketide synthase associated protein papA1  50.31 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0270  condensation domain-containing protein  46.17 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0404  condensation domain-containing protein  45.53 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0245  PapA3_1  45.11 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0255  PapA3_1  45.11 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100826  decreased coverage  0.00393539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0235  PapA3_1  45.11 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3562  condensation domain protein  26.47 
 
 		 436 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0410  condensation domain protein  25.48 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0297  condensation domain protein  25 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1032  condensation domain protein  26.1 
 
 		 486 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1833  condensation domain protein  26.32 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  23.08 
 
 		 2875 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  23.11 
 
 		 601 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189301  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11561  polyketide synthase associated protein papA4  40.51 
 
 		 165 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3419  amino acid adenylation domain protein  23.14 
 
 		 1872 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  23.89 
 
 		 2883 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  24.14 
 
 		 4318 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  25.52 
 
 		 5750 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  25 
 
 		 5926 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  21.65 
 
 		 7168 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  19.51 
 
 		 1449 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  24.14 
 
 		 3127 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  24.14 
 
 		 3133 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  24.14 
 
 		 4239 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  24.14 
 
 		 4265 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  21.88 
 
 		 3331 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1678  amino acid adenylation domain protein  21.46 
 
 		 1393 aa  55.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  22.91 
 
 		 5929 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  23.82 
 
 		 4265 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  24.64 
 
 		 2573 aa  54.3  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  25.87 
 
 		 1104 aa  53.5  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  25.95 
 
 		 3404 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  22.05 
 
 		 2997 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09226  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  22.04 
 
 		 2559 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  21.05 
 
 		 3207 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  22.78 
 
 		 4336 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  21.97 
 
 		 3470 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  23.58 
 
 		 2448 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  22.91 
 
 		 4336 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  21.71 
 
 		 4186 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  22.79 
 
 		 9175 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  24.92 
 
 		 2125 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  21.58 
 
 		 1146 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  20.1 
 
 		 5738 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  24.13 
 
 		 1726 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  21.68 
 
 		 3942 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  27.59 
 
 		 1506 aa  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  21.41 
 
 		 2033 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  18.99 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  20.67 
 
 		 3374 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  19.19 
 
 		 1550 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  20.41 
 
 		 3432 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  21.7 
 
 		 4991 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  22.64 
 
 		 1553 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2107  condensation domain-containing protein  19.33 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  23.48 
 
 		 2439 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1246  condensation domain protein  26.74 
 
 		 938 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  26.89 
 
 		 2581 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  21.36 
 
 		 4317 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  22.09 
 
 		 13537 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  18.33 
 
 		 1142 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  22.92 
 
 		 3639 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  19.9 
 
 		 2664 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  20.18 
 
 		 4960 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  24.89 
 
 		 4483 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  22.78 
 
 		 5372 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  24.49 
 
 		 1104 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  23.08 
 
 		 3101 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  20.86 
 
 		 4968 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  20.25 
 
 		 4960 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  19.85 
 
 		 3824 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  22.13 
 
 		 4502 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  21.32 
 
 		 4317 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  22.91 
 
 		 3432 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  19.65 
 
 		 2395 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  24.07 
 
 		 2370 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  21.61 
 
 		 8914 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  21.76 
 
 		 8915 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  22.19 
 
 		 3018 aa  47  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4054  amino acid adenylation domain-containing protein  23.09 
 
 		 1690 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631395  normal  0.292713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  19.65 
 
 		 2395 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  21.23 
 
 		 3308 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  20.98 
 
 		 1745 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  24.05 
 
 		 1638 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  20.98 
 
 		 1745 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  23.96 
 
 		 2201 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  22.22 
 
 		 1356 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  23.25 
 
 		 1668 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  25.93 
 
 		 2333 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  21.45 
 
 		 9498 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1674  linear gramicidin synthetase subunit B  24.06 
 
 		 1567 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995646  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  21.29 
 
 		 1745 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  22.37 
 
 		 2137 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  21.67 
 
 		 2174 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  24.51 
 
 		 4342 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>