25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13854 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13854  polyketide synthase associated protein papA2  100 
 
 
468 aa  971    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3118  condensation domain-containing protein  55.58 
 
 
518 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3178  condensation domain-containing protein  55.58 
 
 
488 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268597  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3129  condensation domain-containing protein  55.58 
 
 
488 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11206  polyketide synthase associated protein papA3  53.8 
 
 
472 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13858  polyketide synthase associated protein papA1  53.68 
 
 
511 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0270  condensation domain-containing protein  46.32 
 
 
473 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0404  condensation domain-containing protein  46.32 
 
 
473 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0245  PapA3_1  46.54 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0235  PapA3_1  46.54 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0255  PapA3_1  46.54 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100826  decreased coverage  0.00393539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3562  condensation domain protein  25.64 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1032  condensation domain protein  24.12 
 
 
486 aa  123  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0410  condensation domain protein  25.64 
 
 
474 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0297  condensation domain protein  25.72 
 
 
492 aa  97.8  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1833  condensation domain protein  24.94 
 
 
496 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11561  polyketide synthase associated protein papA4  37.88 
 
 
165 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  23.83 
 
 
601 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189301  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  24.42 
 
 
4265 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  24.42 
 
 
4265 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  24.42 
 
 
4239 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4505  condensation domain protein  24.77 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  22.75 
 
 
2201 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4538  condensation domain protein  25.21 
 
 
451 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  23.03 
 
 
2174 aa  43.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>