89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1667 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1667  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 316 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3995  alpha/beta hydrolase fold  39.82 
 
 		 465 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  38.51 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2482  putative hydrolase  32.55 
 
 		 368 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1471  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.15 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1430  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.15 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1331  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.15 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1406  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.15 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1208  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.15 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1231  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.15 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1369  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.8 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1210  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.15 
 
 		 361 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3975  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.8 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3795  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0629  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4553  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1232  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.12 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0105  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1044  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.7 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2385  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.4 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.767924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4161  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3301  acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 991 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3551  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46290  poly(3-hydroxybutyrate) synthase subunit  27.8 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3006  acyl-CoA synthetase  26.9 
 
 		 1005 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2962  acyl-CoA synthetase  26.9 
 
 		 1005 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2977  acyl-CoA synthetase  26.9 
 
 		 1005 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120124  normal  0.0134257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3517  acyl-CoA synthetase  29.56 
 
 		 989 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1241  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.31 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2062  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  24.76 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.691565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6101  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  28.37 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2323  hypothetical protein  25.82 
 
 		 604 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0411  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  28.09 
 
 		 626 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11700  acyl-CoA synthetase  26.79 
 
 		 999 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.257643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  24.15 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3455  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  27.27 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35365  normal  0.806898 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.15 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 1002 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.457495  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.15 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  18.62 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.11 
 
 		 530 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7778  putative Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase family protein  24.58 
 
 		 509 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101171  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3213  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  24 
 
 		 605 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  24.91 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0084  PHA synthase subunit PhaC  26.35 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.26 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1023  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  26.62 
 
 		 584 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2038  hypothetical protein  25.37 
 
 		 588 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1099  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.45 
 
 		 368 aa  52.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2380  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  24.82 
 
 		 585 aa  53.1  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.62002  hitchhiker  0.0000114827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2061  putative poly-beta-hydroxyalkanoate synthase  24.09 
 
 		 595 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.444104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4207  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  26.39 
 
 		 589 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2971  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  26.69 
 
 		 594 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745288  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3030  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  24.66 
 
 		 606 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3566  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  26.3 
 
 		 581 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  21.57 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1267  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 		 981 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2695  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  23.58 
 
 		 573 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7292  putative poly-beta-hydroxyalkanoate synthase  24.26 
 
 		 606 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  21.99 
 
 		 381 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2381  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  22.51 
 
 		 563 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  19.66 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0358  putative poly-beta-hydroxyalkanoate synthasephbc  24 
 
 		 600 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1149  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  23.13 
 
 		 648 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000277322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.57 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0104  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  21.34 
 
 		 611 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.84 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0428  poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase  22.76 
 
 		 627 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1106  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  23.84 
 
 		 618 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5596  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  23.7 
 
 		 619 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1308  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  26.53 
 
 		 585 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226931  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5122  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase / polyhydroxyalkanoic acid synthase  23.31 
 
 		 636 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2098  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  22.87 
 
 		 588 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4423  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  23.55 
 
 		 582 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1170  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  20.49 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1822  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  23.68 
 
 		 583 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00929  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase (Poly(3-hydroxybutyrate) polymerase) (PHB polymerase) (PHB synthase) (Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase)  21.5 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0858058  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4313  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  23.55 
 
 		 582 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.491519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23630  PHB synthase  22.09 
 
 		 567 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1257  putative polyhydroxyalkanoic synthase, PHA synthase  22.7 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1368  poly-beta-hydroxybutyrate synthase  22.56 
 
 		 589 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3066  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000595746  normal  0.0576025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5757  putative poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  25 
 
 		 621 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2917  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  22.7 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2009  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  24.44 
 
 		 603 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0631  Poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase-like protein  26.23 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.961378 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5103  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  23.7 
 
 		 600 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109618  normal  0.785787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.55 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>