More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1183 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1183  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
325 aa  648    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.23 
 
 
325 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0092  oligopeptide transport system permease protein  64.92 
 
 
336 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1022  hypothetical protein  63.69 
 
 
325 aa  437  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0989  hypothetical protein  63.69 
 
 
325 aa  437  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1670  oligopeptide ABC transporter permease protein  65.54 
 
 
325 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0103707  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2063  oligopeptide ABC transporter, permease protein  64 
 
 
336 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1317  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.92 
 
 
325 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0651157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.69 
 
 
325 aa  435  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0933  ABC transporter, inner membrane subunit  65.85 
 
 
325 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1265  peptide ABC transporter, permease protein, putative  60.62 
 
 
325 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0384598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 
327 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1751  IM pore protein  53.07 
 
 
327 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0205  hypothetical protein  37.96 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0214  hypothetical protein  37.96 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3694  IM pore protein  35.26 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
308 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
324 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 
326 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
326 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
309 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
325 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
326 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
339 aa  152  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  31.53 
 
 
339 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7517  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  32.74 
 
 
317 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
332 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
311 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.166982  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
313 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.36 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
343 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
350 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
315 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  33.24 
 
 
324 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
346 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.4 
 
 
313 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 
321 aa  145  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1849  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.53 
 
 
338 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
316 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
344 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
318 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 
318 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
313 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
318 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
314 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552398  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  33.93 
 
 
314 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.61 
 
 
313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  30.29 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
321 aa  139  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
313 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5912  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.92 
 
 
339 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
316 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.585262  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  29.31 
 
 
313 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
343 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
344 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
344 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114687  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
321 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  27.88 
 
 
359 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.16 
 
 
336 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29 
 
 
313 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3876  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  29.19 
 
 
336 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
322 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0503  ABC transporter permease protein  29.23 
 
 
311 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  29.45 
 
 
321 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
321 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  30.48 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.887108 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 
321 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
352 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000389159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 
321 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  30.36 
 
 
327 aa  136  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  29.17 
 
 
318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  29.17 
 
 
318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627946 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  31.12 
 
 
313 aa  135  8e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
306 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  29.3 
 
 
339 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  29.3 
 
 
339 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  29.3 
 
 
339 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  29.3 
 
 
339 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  29.3 
 
 
339 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>