More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0933 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0933  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 325 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0092  oligopeptide transport system permease protein  73.54 
 
 		 336 aa  495  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1670  oligopeptide ABC transporter permease protein  71.38 
 
 		 325 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0103707  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  72.31 
 
 		 325 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2063  oligopeptide ABC transporter, permease protein  72.31 
 
 		 336 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1265  peptide ABC transporter, permease protein, putative  71.69 
 
 		 325 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0384598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.23 
 
 		 325 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1022  hypothetical protein  67.69 
 
 		 325 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0989  hypothetical protein  67.69 
 
 		 325 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1317  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  68.31 
 
 		 325 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0651157 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1183  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  65.85 
 
 		 325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.06 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1751  IM pore protein  57.06 
 
 		 327 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0205  hypothetical protein  40.43 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0214  hypothetical protein  40.43 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3694  IM pore protein  35.87 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7517  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  29.22 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 		 324 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  31.4 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.46 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  28.4 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  30.95 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  33.15 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.15 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  28.86 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  28.86 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  28.98 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  29.51 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  30.36 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  29.48 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  29.75 
 
 		 339 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  32.87 
 
 		 336 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  29.15 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  29.23 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.68 
 
 		 318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.88 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.88 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.91 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  29.75 
 
 		 339 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  29.75 
 
 		 339 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.06 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  29.09 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692911 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  29.09 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  29.09 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  29.36 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  29.09 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  29.09 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  29.09 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  29.09 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  29.09 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  29.09 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  28.81 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.68 
 
 		 336 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.86 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  28.81 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  28.81 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  28.81 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  28.81 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>