More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1067 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1067  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.325142  normal  0.0149181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  85.39 
 
 		 89 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  148  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 100 aa  147  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  81.61 
 
 		 90 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  78.65 
 
 		 89 aa  143  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  143  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  76.74 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  70.79 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  69.77 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  68.6 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1517  ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  68.29 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  62.92 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3955  ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1380  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1338  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00957832  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3325  ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110439  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3556  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0783  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1188  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1099  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0916  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.275461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>