More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1380 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1380  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1338  30S ribosomal protein S15  98.88 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00957832  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  140  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  140  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  76.4 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  73.03 
 
 		 91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  68.54 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  72.73 
 
 		 90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  69.66 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  66.28 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3955  ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1517  ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3556  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1067  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.325142  normal  0.0149181 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  65.12 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  62.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1188  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1509  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.696387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3325  ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  71.83 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0783  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1099  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0916  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.275461  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>