More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0030 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 1568 bp  870    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0020  16S ribosomal RNA  88.03 
 
 		 1508 bp  955    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 1568 bp  870    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0052  16S ribosomal RNA  88.03 
 
 		 1508 bp  955    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0030  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1554 bp  3081    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0532181  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1513 bp  652    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0030  16S ribosomal RNA  99.23 
 
 		 1563 bp  2977    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000298202  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0016  16S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 1359 bp  1481    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0176439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0021  16S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 1359 bp  1481    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.011695  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0031  16S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 1359 bp  1481    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0036  16S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 1359 bp  1481    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00368455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1692 bp  573  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1692 bp  573  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 1533 bp  565  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 1533 bp  565  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 1533 bp  565  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  83.3 
 
 		 1532 bp  553  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  83.3 
 
 		 1532 bp  553  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1532 bp  549  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 1532 bp  549  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  81.04 
 
 		 1471 bp  498  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 1545 bp  428  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 1545 bp  428  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1546 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1546 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1546 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1546 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1546 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1544 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1544 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1545 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1546 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1545 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1544 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1545 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1546 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1546 bp  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  89.3 
 
 		 1541 bp  416  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  89.3 
 
 		 1541 bp  416  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  89.78 
 
 		 1546 bp  412  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  89.78 
 
 		 1546 bp  412  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0034  16S ribosomal RNA  81.1 
 
 		 1543 bp  400  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0312454  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0012  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 1497 bp  400  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000389659  normal  0.664476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0039  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 1497 bp  400  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000419568  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0056  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 1497 bp  400  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000319256  normal  0.0498462 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  81.1 
 
 		 1543 bp  400  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  81.64 
 
 		 1550 bp  381  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  81.64 
 
 		 1550 bp  381  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  87.9 
 
 		 1466 bp  365  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  87.9 
 
 		 1466 bp  365  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  81.38 
 
 		 1545 bp  365  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  81.38 
 
 		 1545 bp  365  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  87.9 
 
 		 1431 bp  365  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  80.74 
 
 		 1548 bp  363  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  80.74 
 
 		 1548 bp  363  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  80.74 
 
 		 1548 bp  363  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  80.74 
 
 		 1548 bp  363  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 1431 bp  357  5.9999999999999994e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0011  16S ribosomal RNA  81.25 
 
 		 1542 bp  357  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0038  16S ribosomal RNA  81.25 
 
 		 1542 bp  357  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 1473 bp  341  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 1473 bp  341  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01550  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1505 bp  341  3.9999999999999995e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08380  16S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 1505 bp  341  3.9999999999999995e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.793427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  86.76 
 
 		 1526 bp  337  6e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 1532 bp  331  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 1532 bp  331  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 1525 bp  329  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1510 bp  327  6e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0006  16S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 1528 bp  325  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0009  16S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 1538 bp  325  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000955328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0033  16S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 1538 bp  325  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  83.5 
 
 		 1510 bp  319  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0052  16S ribosomal RNA  80.7 
 
 		 1471 bp  317  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0176979  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0046  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1500 bp  315  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0043  16S ribosomal RNA  80.42 
 
 		 1550 bp  315  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  86.1 
 
 		 1526 bp  315  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0032  16S ribosomal RNA  80.42 
 
 		 1550 bp  315  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0577345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  86.39 
 
 		 1544 bp  313  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  86.39 
 
 		 1544 bp  313  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  86.39 
 
 		 1544 bp  313  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  86.39 
 
 		 1544 bp  313  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08960  16S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 1504 bp  311  3e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.272562 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00120  16S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 1504 bp  311  3e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0247514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0009  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1459 bp  311  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000834644  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3084  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1470 bp  311  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448941  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0384  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1470 bp  311  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02350  16S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 1504 bp  311  3e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  86.33 
 
 		 1555 bp  311  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0052  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1459 bp  311  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000233456  normal  0.528995 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1544 bp  309  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1544 bp  309  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1544 bp  309  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1509 bp  309  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1544 bp  309  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1544 bp  309  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1544 bp  309  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1544 bp  309  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1544 bp  309  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 1544 bp  309  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>