More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0034 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 1548 bp  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 1548 bp  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 1512 bp  710    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1563 bp  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 1510 bp  710    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 1563 bp  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1692 bp  3354    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  89.65 
 
 		 1568 bp  898    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0059  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 1538 bp  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  89.65 
 
 		 1568 bp  898    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  82.39 
 
 		 1548 bp  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  87.05 
 
 		 1431 bp  860    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 1546 bp  702    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0073  16S ribosomal RNA  85.91 
 
 		 1661 bp  813    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000134012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  85.7 
 
 		 1554 bp  797    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0007  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 1538 bp  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 1546 bp  710    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  87.86 
 
 		 1532 bp  965    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 1546 bp  702    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1548 bp  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 1431 bp  868    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1692 bp  3354    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 1546 bp  694    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  82.39 
 
 		 1548 bp  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  85.7 
 
 		 1554 bp  797    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0006  16S ribosomal RNA  85.91 
 
 		 1554 bp  813    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00174832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 1546 bp  702    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0041  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 1538 bp  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0625865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  85.91 
 
 		 1671 bp  813    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1491 bp  737    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1491 bp  737    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 1548 bp  745    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 1548 bp  745    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 1536 bp  722    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0034  16S ribosomal RNA  85.86 
 
 		 1559 bp  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 1546 bp  710    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 1532 bp  967    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 1532 bp  967    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 1546 bp  702    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 1466 bp  868    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 1466 bp  868    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  87.86 
 
 		 1532 bp  965    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  82.39 
 
 		 1548 bp  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  87.97 
 
 		 1555 bp  1221    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 		 1513 bp  870    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 1546 bp  702    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 1510 bp  710    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0009  16S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 1538 bp  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000955328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0033  16S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 1538 bp  654    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 1545 bp  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 1545 bp  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 1546 bp  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 1545 bp  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 1545 bp  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 1546 bp  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 1545 bp  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0013  16S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 1555 bp  617  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000280692  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0051  16S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 1555 bp  617  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1471 bp  613  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1544 bp  611  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1544 bp  607  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0056  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1536 bp  605  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.67305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  85.24 
 
 		 1544 bp  603  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0027  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1536 bp  605  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.075558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0062  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1536 bp  605  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0034  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1536 bp  605  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0052  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1471 bp  605  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0176979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0005  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1541 bp  597  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0138974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0021  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1541 bp  597  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.877724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0028  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1541 bp  597  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0078  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1541 bp  597  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0085  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1541 bp  597  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0009  16S ribosomal RNA  83.32 
 
 		 1459 bp  577  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000834644  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0384  16S ribosomal RNA  83.32 
 
 		 1470 bp  577  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0052  16S ribosomal RNA  83.32 
 
 		 1459 bp  577  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000233456  normal  0.528995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3084  16S ribosomal RNA  83.32 
 
 		 1470 bp  577  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448941  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0030  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1554 bp  573  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0532181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0041  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1472 bp  569  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0079  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1472 bp  569  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0052  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1472 bp  569  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0008  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1472 bp  569  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0035  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1472 bp  569  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0066  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1472 bp  569  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0923471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0021  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1472 bp  569  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0001  16S ribosomal RNA  83 
 
 		 1519 bp  567  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0020  16S ribosomal RNA  83 
 
 		 1504 bp  567  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0142  16S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000978777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 1544 bp  569  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  83.37 
 
 		 1551 bp  567  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  83.37 
 
 		 1551 bp  567  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  83.37 
 
 		 1551 bp  567  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>