More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0012 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0012  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1497 bp  2968    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000389659  normal  0.664476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0032  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1511 bp  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0039  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1497 bp  2968    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000419568  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01550  16S ribosomal RNA  91.27 
 
 		 1505 bp  1905    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0004  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1511 bp  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08960  16S ribosomal RNA  91.29 
 
 		 1504 bp  1647    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.272562 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0056  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1497 bp  2968    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000319256  normal  0.0498462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  87.54 
 
 		 1536 bp  837    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 1498 bp  999    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0044  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1511 bp  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0046  16S ribosomal RNA  87.37 
 
 		 1500 bp  1417    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473893 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02350  16S ribosomal RNA  91.29 
 
 		 1504 bp  1647    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 1498 bp  999    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00120  16S ribosomal RNA  91.29 
 
 		 1504 bp  1647    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0247514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08380  16S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 1505 bp  1897    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.793427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  85.55 
 
 		 1512 bp  954    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  85.55 
 
 		 1512 bp  954    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  88.76 
 
 		 1513 bp  793    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 1509 bp  1033    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0023  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 1513 bp  672    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0040  16S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 1513 bp  672    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0046  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1505 bp  638  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000115462  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0049  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1505 bp  638  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000269121  hitchhiker  0.000017659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1501 bp  628  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1501 bp  628  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1501 bp  628  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0027  16S ribosomal RNA  84.5 
 
 		 1510 bp  603  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0020  16S ribosomal RNA  84.5 
 
 		 1510 bp  603  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0015  16S ribosomal RNA  84.5 
 
 		 1510 bp  603  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0062  16S ribosomal RNA  84.5 
 
 		 1510 bp  603  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0065  16S ribosomal RNA  84.5 
 
 		 1510 bp  603  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0029  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1519 bp  464  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.247127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0045  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1520 bp  464  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000645163  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0013  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1519 bp  464  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0052  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1519 bp  464  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0363262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1546 bp  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1545 bp  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  87.05 
 
 		 1525 bp  458  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1546 bp  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1545 bp  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1546 bp  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1546 bp  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1546 bp  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1546 bp  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 1546 bp  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 1510 bp  452  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 1510 bp  452  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 1544 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 1545 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 1544 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0060  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1505 bp  448  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 1544 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 1545 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0011  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1505 bp  448  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 1546 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0023  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1505 bp  448  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0039  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1505 bp  448  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 1546 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 1526 bp  446  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0064  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 1506 bp  448  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 1545 bp  448  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 1532 bp  438  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 1532 bp  438  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 1532 bp  438  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 1532 bp  438  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  89.7 
 
 		 1546 bp  430  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0005  16S ribosomal RNA  86.52 
 
 		 1528 bp  432  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.022366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0031  16S ribosomal RNA  86.52 
 
 		 1528 bp  432  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00134109  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0043  16S ribosomal RNA  86.52 
 
 		 1528 bp  432  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942291  normal  0.0921912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0005  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 1519 bp  424  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0297907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0060  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1512 bp  424  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.889945  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0045  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 1519 bp  424  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0063  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1512 bp  424  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0030  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 1519 bp  424  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0053  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1512 bp  424  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0036  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1512 bp  424  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0700117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0035  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 1507 bp  418  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000731111  normal  0.0208084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0053  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 1507 bp  418  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0136831  normal  0.0232267 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  86.35 
 
 		 1512 bp  416  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0068  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 1507 bp  418  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253796  decreased coverage  0.00746602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25530  16S ribosomal RNA  85.97 
 
 		 1527 bp  414  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07440  16S ribosomal RNA  85.97 
 
 		 1527 bp  414  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.496613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05560  16S ribosomal RNA  85.97 
 
 		 1527 bp  414  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0024  16S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 1515 bp  414  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0041  16S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 1515 bp  414  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00000734371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0021  16S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 1515 bp  414  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.222363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0038  16S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 1515 bp  414  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000160883  decreased coverage  0.00357812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0021  16S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 1515 bp  414  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812892  normal  0.0276093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0038  16S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 1515 bp  414  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00000101805  decreased coverage  0.0014476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14046  16S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 1540 bp  412  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.73486e-38  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0052  16S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 1471 bp  406  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0176979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 1471 bp  406  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0015  16S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 1508 bp  400  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.414604  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1545 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1545 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1550 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 1550 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0030  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 1554 bp  400  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0532181  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0032  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1520 bp  400  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000901783  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0041  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1520 bp  400  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>