More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_R0020 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0030  16S ribosomal RNA  88.22 
 
 		 1563 bp  967    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000298202  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0036  16S ribosomal RNA  92.07 
 
 		 1359 bp  1255    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00368455  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0031  16S ribosomal RNA  92.07 
 
 		 1359 bp  1255    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0021  16S ribosomal RNA  92.07 
 
 		 1359 bp  1255    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.011695  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0016  16S ribosomal RNA  92.07 
 
 		 1359 bp  1255    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0176439  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0030  16S ribosomal RNA  88.03 
 
 		 1554 bp  955    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0532181  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0052  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1508 bp  2989    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0020  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1508 bp  2989    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822564  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  82.52 
 
 		 1532 bp  634  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  82.52 
 
 		 1532 bp  634  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  82.43 
 
 		 1532 bp  626  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  82.43 
 
 		 1532 bp  626  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  83.18 
 
 		 1568 bp  462  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  83.18 
 
 		 1568 bp  462  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1510 bp  458  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  80.15 
 
 		 1512 bp  456  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1510 bp  458  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1533 bp  448  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1533 bp  448  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1533 bp  448  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0052  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1500 bp  440  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.605716  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0017  16S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 1500 bp  432  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.16688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 1513 bp  369  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0038  16S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 1531 bp  345  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.966561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0057  16S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 1531 bp  345  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.501783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0005  16S ribosomal RNA  81.55 
 
 		 1512 bp  327  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0050  16S ribosomal RNA  81.55 
 
 		 1512 bp  327  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.27302  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0027  16S ribosomal RNA  81.55 
 
 		 1512 bp  327  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.931505  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  80.99 
 
 		 1525 bp  323  7.999999999999999e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  80.99 
 
 		 1526 bp  323  7.999999999999999e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  80.7 
 
 		 1692 bp  323  7.999999999999999e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  80.7 
 
 		 1692 bp  323  7.999999999999999e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  88.34 
 
 		 1541 bp  321  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  88.34 
 
 		 1541 bp  321  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  81.03 
 
 		 1509 bp  309  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  80.38 
 
 		 1474 bp  303  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  80.38 
 
 		 1474 bp  303  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  80.38 
 
 		 1477 bp  301  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  80.38 
 
 		 1477 bp  301  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  80.38 
 
 		 1477 bp  301  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05560  16S ribosomal RNA  81.09 
 
 		 1527 bp  299  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07440  16S ribosomal RNA  81.09 
 
 		 1527 bp  299  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.496613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25530  16S ribosomal RNA  81.09 
 
 		 1527 bp  299  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0035  16S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 1507 bp  287  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000731111  normal  0.0208084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  80.27 
 
 		 1478 bp  287  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0068  16S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 1507 bp  287  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253796  decreased coverage  0.00746602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  80.74 
 
 		 1512 bp  287  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  80.74 
 
 		 1512 bp  287  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0053  16S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 1507 bp  287  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0136831  normal  0.0232267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1545 bp  281  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1545 bp  281  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 1498 bp  281  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 1498 bp  281  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0045  16S ribosomal RNA  80.05 
 
 		 1520 bp  281  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000645163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1546 bp  281  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0052  16S ribosomal RNA  80.03 
 
 		 1519 bp  278  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0363262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0029  16S ribosomal RNA  80.03 
 
 		 1519 bp  278  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.247127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0013  16S ribosomal RNA  80.03 
 
 		 1519 bp  278  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  80.26 
 
 		 1488 bp  276  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  80.26 
 
 		 1490 bp  276  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  80.26 
 
 		 1488 bp  276  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  80.26 
 
 		 1490 bp  276  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1546 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1545 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1545 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1546 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1546 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1546 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1545 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1546 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1544 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1546 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1544 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1544 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1548 bp  274  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1548 bp  274  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1548 bp  274  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1548 bp  274  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1548 bp  274  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1548 bp  274  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1546 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1546 bp  274  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0030  16S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 1526 bp  266  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000520624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0001  16S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 1525 bp  266  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1546 bp  266  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0027  16S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 1526 bp  266  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000250907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0049  16S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 1526 bp  266  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000250907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0009  16S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 1526 bp  266  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000875225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0060  16S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 1526 bp  266  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0041  16S ribosomal RNA  85.67 
 
 		 1433 bp  264  7e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0037  16S ribosomal RNA  79.7 
 
 		 1497 bp  262  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0042  16S ribosomal RNA  79.7 
 
 		 1497 bp  262  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21650  16S ribosomal RNA  80.24 
 
 		 1523 bp  260  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0589371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  79.62 
 
 		 1431 bp  260  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0044  16S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 1511 bp  260  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  79.62 
 
 		 1466 bp  260  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04500  16S ribosomal RNA  80.24 
 
 		 1523 bp  260  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  79.62 
 
 		 1431 bp  260  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  79.62 
 
 		 1466 bp  260  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13550  16S ribosomal RNA  80.24 
 
 		 1523 bp  260  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0361691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>