More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_R0045 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  84.12 
 
 		 1544 bp  698    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  84.12 
 
 		 1545 bp  696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0049  16S ribosomal RNA  89.64 
 
 		 1505 bp  1711    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000269121  hitchhiker  0.000017659 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14290    90.11 
 
 		 2926 bp  1185    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0005  16S ribosomal RNA  91.73 
 
 		 1519 bp  1955    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0297907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1546 bp  670    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  88.92 
 
 		 1498 bp  1358    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  91.61 
 
 		 1501 bp  1677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04500  16S ribosomal RNA  89.94 
 
 		 1523 bp  1475    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13550  16S ribosomal RNA  89.94 
 
 		 1523 bp  1475    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0361691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0035  16S ribosomal RNA  90.9 
 
 		 1507 bp  1616    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000731111  normal  0.0208084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  84.03 
 
 		 1545 bp  688    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1544 bp  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0044  16S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 1511 bp  1604    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0068  16S ribosomal RNA  90.9 
 
 		 1507 bp  1616    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253796  decreased coverage  0.00746602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  84.03 
 
 		 1545 bp  688    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0030  16S ribosomal RNA  91.73 
 
 		 1519 bp  1955    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  91.61 
 
 		 1501 bp  1677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21650  16S ribosomal RNA  89.94 
 
 		 1523 bp  1475    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0589371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0013  16S ribosomal RNA  99.87 
 
 		 1519 bp  2989    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0011  16S ribosomal RNA  91.53 
 
 		 1505 bp  1675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0065  16S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 1510 bp  1635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0062  16S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 1510 bp  1635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0027  16S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 1510 bp  1635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05560  16S ribosomal RNA  91.1 
 
 		 1527 bp  1598    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0064  16S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 1506 bp  1661    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25530  16S ribosomal RNA  91.1 
 
 		 1527 bp  1598    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0079  16S ribosomal RNA  90.46 
 
 		 1532 bp  1241    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0053  16S ribosomal RNA  90.9 
 
 		 1507 bp  1616    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0136831  normal  0.0232267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07440  16S ribosomal RNA  91.1 
 
 		 1527 bp  1598    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.496613 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  88.92 
 
 		 1498 bp  1358    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0004  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 		 1526 bp  959    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0001  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 		 1525 bp  952    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.892874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  91.61 
 
 		 1501 bp  1677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0010  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1526 bp  967    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12340  16S ribosomal RNA  90.77 
 
 		 1527 bp  1558    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0039  16S ribosomal RNA  88.45 
 
 		 1517 bp  1574    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0163381  hitchhiker  0.00923101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0015  16S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 1510 bp  1635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0020  16S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 1510 bp  1635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0076  16S ribosomal RNA  88.77 
 
 		 1514 bp  1580    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0555033 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03860  16S ribosomal RNA  90.63 
 
 		 1632 bp  1538    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0341976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0060  16S ribosomal RNA  91.53 
 
 		 1505 bp  1675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0045  16S ribosomal RNA  91.73 
 
 		 1519 bp  1955    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0025  16S ribosomal RNA  90.97 
 
 		 1471 bp  1853    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0044  16S ribosomal RNA  90.97 
 
 		 1471 bp  1853    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0049  16S ribosomal RNA  90.9 
 
 		 1471 bp  1846    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0067  16S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 1471 bp  1861    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0018  16S ribosomal RNA  88.45 
 
 		 1517 bp  1574    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.298469  normal  0.903608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07380  16S ribosomal RNA  90.77 
 
 		 1527 bp  1558    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0389035  normal  0.172558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  83.65 
 
 		 1546 bp  662    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1546 bp  670    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1555 bp  708    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 1512 bp  1661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 1512 bp  1661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0070  16S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 1534 bp  1233    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0736404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1546 bp  670    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1546 bp  670    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0046  16S ribosomal RNA  89.64 
 
 		 1505 bp  1711    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000115462  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0019  16S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 1534 bp  1233    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0024  16S ribosomal RNA  89.01 
 
 		 1515 bp  1402    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0041  16S ribosomal RNA  89.01 
 
 		 1515 bp  1402    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00000734371  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1532 bp  656    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1532 bp  656    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0016  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1517 bp  1659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.672174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0021  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1517 bp  1659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0029  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1517 bp  1659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0064  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1517 bp  1659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0067  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1517 bp  1659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1509 bp  1790    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  84.03 
 
 		 1545 bp  688    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0007  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1526 bp  967    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  84.12 
 
 		 1544 bp  698    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 1546 bp  676    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0032  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1520 bp  1538    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000901783  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0041  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1520 bp  1538    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0021  16S ribosomal RNA  89.01 
 
 		 1515 bp  1402    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.222363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0038  16S ribosomal RNA  89.01 
 
 		 1515 bp  1402    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000160883  decreased coverage  0.00357812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0027  16S ribosomal RNA  88.98 
 
 		 1515 bp  805    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0042  16S ribosomal RNA  88.98 
 
 		 1515 bp  805    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0519048  normal  0.0131861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0032  16S ribosomal RNA  90.46 
 
 		 1532 bp  1241    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0057  16S ribosomal RNA  90.46 
 
 		 1532 bp  1241    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0063  16S ribosomal RNA  91.54 
 
 		 1512 bp  1671    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0060  16S ribosomal RNA  91.54 
 
 		 1512 bp  1671    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.889945  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  83.65 
 
 		 1546 bp  662    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1546 bp  670    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0023  16S ribosomal RNA  91.53 
 
 		 1505 bp  1675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  84.12 
 
 		 1545 bp  696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0039  16S ribosomal RNA  91.53 
 
 		 1505 bp  1675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 1546 bp  666    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0021  16S ribosomal RNA  89.01 
 
 		 1515 bp  1402    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812892  normal  0.0276093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0038  16S ribosomal RNA  89.01 
 
 		 1515 bp  1402    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00000101805  decreased coverage  0.0014476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0023  16S ribosomal RNA  88.4 
 
 		 1513 bp  1560    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0040  16S ribosomal RNA  88.4 
 
 		 1513 bp  1560    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0005  16S ribosomal RNA  91.46 
 
 		 1528 bp  1923    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.022366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0031  16S ribosomal RNA  91.46 
 
 		 1528 bp  1923    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00134109  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0043  16S ribosomal RNA  91.46 
 
 		 1528 bp  1923    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942291  normal  0.0921912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0027  16S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 1511 bp  1604    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14046  16S ribosomal RNA  88.94 
 
 		 1540 bp  1439    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.73486e-38  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1546 bp  670    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0036  16S ribosomal RNA  91.54 
 
 		 1512 bp  1671    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0700117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>