More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0006 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  89.73 
 
 		 1479 bp  1683    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  91.82 
 
 		 1479 bp  1933    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  82.69 
 
 		 1521 bp  735    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  82.69 
 
 		 1521 bp  735    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1498 bp  1618    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1465 bp  1576    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  89.84 
 
 		 1401 bp  1562    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  89 
 
 		 1465 bp  1584    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 		 1477 bp  1842    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  82.61 
 
 		 1521 bp  728    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  82.69 
 
 		 1521 bp  735    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  89.26 
 
 		 1394 bp  1507    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 		 1488 bp  1852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 		 1490 bp  1852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 		 1488 bp  1852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 		 1490 bp  1852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  89.84 
 
 		 1401 bp  1562    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  89.34 
 
 		 1465 bp  1624    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  89.65 
 
 		 1479 bp  1653    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  89.51 
 
 		 1458 bp  1614    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  89.62 
 
 		 1440 bp  1596    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  89.62 
 
 		 1440 bp  1596    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  91.82 
 
 		 1479 bp  1933    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  89.06 
 
 		 1465 bp  1592    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  91.28 
 
 		 1490 bp  1850    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  91.28 
 
 		 1490 bp  1850    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 1544 bp  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 		 1477 bp  1842    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 1479 bp  1691    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1474 bp  2922    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1474 bp  2922    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 		 1477 bp  1842    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 1479 bp  1691    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  91.06 
 
 		 1482 bp  1859    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  91.06 
 
 		 1482 bp  1859    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 1544 bp  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 1544 bp  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 1544 bp  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  89.54 
 
 		 1465 bp  1647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 1479 bp  1941    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 		 1478 bp  1836    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  91.82 
 
 		 1479 bp  1933    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0053  16S ribosomal RNA  81.67 
 
 		 1479 bp  622  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0059  16S ribosomal RNA  81.67 
 
 		 1479 bp  622  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0065  16S ribosomal RNA  81.67 
 
 		 1479 bp  622  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.682455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1543 bp  599  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1543 bp  599  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1543 bp  599  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1543 bp  599  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1555 bp  589  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5669  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1509 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1563 bp  577  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1563 bp  577  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0009  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1538 bp  577  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000361089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0003  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1538 bp  577  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011323  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0009  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1538 bp  577  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0003  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1537 bp  577  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193245  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0002  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1540 bp  573  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153302  normal  0.0205506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0085  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1540 bp  573  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000770905  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0007  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1540 bp  573  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  unclonable  0.000000000443158  hitchhiker  0.00339751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0090  16S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 1540 bp  565  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000161015  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  82.41 
 
 		 1536 bp  561  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1587 bp  553  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1587 bp  553  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1587 bp  553  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  82.91 
 
 		 1535 bp  547  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  82.91 
 
 		 1535 bp  547  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1587 bp  545  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1587 bp  545  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1587 bp  545  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0052  16S ribosomal RNA  84.59 
 
 		 1459 bp  533  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000233456  normal  0.528995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0009  16S ribosomal RNA  84.59 
 
 		 1459 bp  533  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000834644  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1548 bp  535  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1548 bp  535  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0384  16S ribosomal RNA  84.59 
 
 		 1470 bp  533  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3084  16S ribosomal RNA  84.59 
 
 		 1470 bp  533  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 1545 bp  529  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 1545 bp  529  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  82.53 
 
 		 1526 bp  531  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  82.81 
 
 		 1548 bp  521  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0012  16S ribosomal RNA  82.01 
 
 		 1641 bp  521  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00349266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  82.81 
 
 		 1548 bp  521  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  82.81 
 
 		 1548 bp  521  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  82.81 
 
 		 1548 bp  521  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0088  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1641 bp  513  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00218417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1551 bp  513  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0059  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1641 bp  513  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0024  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1641 bp  513  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1551 bp  513  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0036  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1639 bp  513  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1641 bp  513  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0084  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1641 bp  513  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.19208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1548 bp  511  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1548 bp  511  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1473 bp  511  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1473 bp  511  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55030  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1535 bp  504  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00361459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55060  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1535 bp  504  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55110  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1535 bp  504  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0208311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55140  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1535 bp  504  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000744342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>