More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0052 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0017  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 1500 bp  2966    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.16688  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0052  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1500 bp  2974    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.605716  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0020  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1508 bp  440  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822564  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0052  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1508 bp  440  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0030  16S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 1554 bp  293  7e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0532181  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0036  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 1359 bp  291  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00368455  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0016  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 1359 bp  291  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0176439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0031  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 1359 bp  291  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0021  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 1359 bp  291  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.011695  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0030  16S ribosomal RNA  86.01 
 
 		 1563 bp  287  5.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000298202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  87.55 
 
 		 1541 bp  242  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  87.55 
 
 		 1541 bp  242  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1612 bp  226  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1612 bp  226  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 1533 bp  226  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1612 bp  226  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1612 bp  226  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 1533 bp  226  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 1533 bp  226  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1612 bp  226  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1612 bp  226  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1612 bp  226  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  83.42 
 
 		 1612 bp  226  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1692 bp  216  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1692 bp  216  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1568 bp  210  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1568 bp  210  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 		 1546 bp  202  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 		 1521 bp  198  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 		 1521 bp  198  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 		 1521 bp  198  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1491 bp  198  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1491 bp  198  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 		 1521 bp  198  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  82.06 
 
 		 1544 bp  196  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  82.06 
 
 		 1544 bp  196  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  82.06 
 
 		 1544 bp  196  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 		 1546 bp  194  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 		 1546 bp  194  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 		 1546 bp  194  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0026  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1502 bp  194  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0029  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1502 bp  194  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000355338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 		 1546 bp  194  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 		 1546 bp  194  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 		 1546 bp  194  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0001  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1502 bp  194  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000922147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0056  16S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 1502 bp  194  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1532 bp  192  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1532 bp  192  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1532 bp  192  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1532 bp  192  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0051  16S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 1506 bp  192  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0057  16S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 1506 bp  192  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0037  16S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 1506 bp  192  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0015  16S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 1506 bp  192  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0009  16S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 1506 bp  192  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0046  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1500 bp  190  8e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473893 
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-3  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1510 bp  188  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-5  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1510 bp  188  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-6  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1510 bp  188  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-7  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1510 bp  188  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SC  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1507 bp  188  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SE  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1507 bp  188  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SF  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1507 bp  188  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SG  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1507 bp  188  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  81.79 
 
 		 1544 bp  188  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  81.77 
 
 		 1546 bp  186  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0061  16S ribosomal RNA  81.5 
 
 		 1559 bp  184  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.925308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0044  16S ribosomal RNA  81.5 
 
 		 1559 bp  184  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02350  16S ribosomal RNA  78.73 
 
 		 1504 bp  184  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0070  16S ribosomal RNA  81.5 
 
 		 1559 bp  184  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.66024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0048  16S ribosomal RNA  81.5 
 
 		 1559 bp  184  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00545182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0083  16S ribosomal RNA  81.5 
 
 		 1559 bp  184  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08960  16S ribosomal RNA  78.73 
 
 		 1504 bp  184  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.272562 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00120  16S ribosomal RNA  78.73 
 
 		 1504 bp  184  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0247514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0095  16S ribosomal RNA  81.5 
 
 		 1559 bp  184  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00647588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0324  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1508 bp  180  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000098756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0356  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1509 bp  180  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0079994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0595  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1508 bp  180  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5647  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1509 bp  180  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.227305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0031  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1508 bp  180  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000247217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0007  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1509 bp  180  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1510 bp  180  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0184  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1508 bp  180  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000878132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1545 bp  180  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1510 bp  180  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1545 bp  180  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1510 bp  180  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1510 bp  180  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1503 bp  180  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1510 bp  180  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0104  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1508 bp  180  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000984323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0347  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1509 bp  180  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0567858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1510 bp  180  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1510 bp  180  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0330  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1508 bp  180  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0091  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1508 bp  180  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.263967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5642  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1509 bp  180  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0485658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5675  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1509 bp  180  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1545 bp  180  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>