More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0038 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  84.1 
 
 		 1473 bp  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  84.1 
 
 		 1473 bp  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1533 bp  3039    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  87.62 
 
 		 1532 bp  1154    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  87.62 
 
 		 1532 bp  1154    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  87.62 
 
 		 1532 bp  1154    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  87.62 
 
 		 1532 bp  1154    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1533 bp  3007    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  99.87 
 
 		 1533 bp  3023    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0032  16S ribosomal RNA  84.8 
 
 		 1550 bp  704    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0577345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0043  16S ribosomal RNA  84.8 
 
 		 1550 bp  704    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  85.81 
 
 		 1543 bp  636  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0034  16S ribosomal RNA  85.81 
 
 		 1543 bp  636  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0312454  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 1466 bp  615  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 1431 bp  615  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 1431 bp  615  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 1466 bp  615  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0060  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1505 bp  603  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1612 bp  603  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1612 bp  603  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1612 bp  603  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1612 bp  603  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1612 bp  603  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1612 bp  603  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1612 bp  603  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1612 bp  603  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0023  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1505 bp  603  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0039  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1505 bp  603  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0011  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1505 bp  603  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0011  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1542 bp  601  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0073  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1542 bp  601  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0064  16S ribosomal RNA  85.32 
 
 		 1506 bp  589  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 1510 bp  589  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 1512 bp  589  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 1510 bp  589  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0030  16S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 1554 bp  565  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0532181  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1541 bp  565  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1541 bp  565  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0059  16S ribosomal RNA  84.3 
 
 		 1538 bp  561  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0007  16S ribosomal RNA  84.3 
 
 		 1538 bp  561  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0041  16S ribosomal RNA  84.3 
 
 		 1538 bp  561  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0625865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1551 bp  557  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1551 bp  557  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1551 bp  557  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1551 bp  557  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0030  16S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 1563 bp  555  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000298202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  82.79 
 
 		 1548 bp  549  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  82.79 
 
 		 1548 bp  549  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0027  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 1536 bp  547  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.075558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0056  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 1536 bp  547  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.67305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0034  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 1536 bp  547  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0062  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 1536 bp  547  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0020  16S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 1504 bp  541  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0056  16S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 1489 bp  541  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  82.81 
 
 		 1548 bp  535  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  82.81 
 
 		 1548 bp  535  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0001  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 1519 bp  535  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0079  16S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 1501 bp  533  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01550  16S ribosomal RNA  84.2 
 
 		 1505 bp  525  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08380  16S ribosomal RNA  84.2 
 
 		 1505 bp  525  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.793427 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0016  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1359 bp  521  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0176439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0021  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1359 bp  521  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.011695  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0031  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1359 bp  521  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0036  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1359 bp  521  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00368455  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0046  16S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 1500 bp  515  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  92.47 
 
 		 1555 bp  500  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 1491 bp  494  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 1491 bp  494  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 1546 bp  488  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 1544 bp  488  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 1544 bp  488  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 1545 bp  488  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 1546 bp  488  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 1544 bp  488  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 1545 bp  488  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 1545 bp  488  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0028  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1513 bp  484  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00237559  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0033  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1513 bp  484  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0017  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1513 bp  484  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  91.25 
 
 		 1545 bp  480  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  91.25 
 
 		 1545 bp  480  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  91.25 
 
 		 1546 bp  480  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  91.25 
 
 		 1546 bp  480  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  91.25 
 
 		 1546 bp  480  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  91.25 
 
 		 1546 bp  480  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  91.25 
 
 		 1546 bp  480  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  91.25 
 
 		 1546 bp  480  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0030  16S ribosomal RNA  90.59 
 
 		 1526 bp  478  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000520624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0049  16S ribosomal RNA  90.59 
 
 		 1526 bp  478  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000250907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0027  16S ribosomal RNA  90.59 
 
 		 1526 bp  478  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000250907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0060  16S ribosomal RNA  90.59 
 
 		 1526 bp  478  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0009  16S ribosomal RNA  90.59 
 
 		 1526 bp  478  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000875225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  90.98 
 
 		 1546 bp  472  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  90.98 
 
 		 1546 bp  472  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0001  16S ribosomal RNA  90.33 
 
 		 1525 bp  470  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 1498 bp  468  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 1498 bp  468  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  83.25 
 
 		 1474 bp  462  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  91.95 
 
 		 1641 bp  460  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 1521 bp  462  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>