More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0033 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0017  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1513 bp  2999    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805608  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0033  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1513 bp  2999    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0028  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1513 bp  2999    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00237559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  83.9 
 
 		 1533 bp  494  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1533 bp  484  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1533 bp  486  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0046  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1549 bp  394  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0033  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1549 bp  394  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0006  16S ribosomal RNA  81.28 
 
 		 1528 bp  385  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1512 bp  313  8e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1510 bp  313  8e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1510 bp  313  8e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  80.49 
 
 		 1525 bp  299  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  80.49 
 
 		 1526 bp  299  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  80.88 
 
 		 1477 bp  299  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  80.88 
 
 		 1477 bp  299  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  80.88 
 
 		 1477 bp  299  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  80.88 
 
 		 1477 bp  299  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  87.58 
 
 		 1568 bp  299  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  87.58 
 
 		 1568 bp  299  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  80.76 
 
 		 1498 bp  297  5e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  80.76 
 
 		 1498 bp  297  5e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1692 bp  293  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 		 1532 bp  293  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1692 bp  293  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 		 1532 bp  293  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 		 1532 bp  293  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 		 1532 bp  293  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0007  16S ribosomal RNA  82.39 
 
 		 1538 bp  276  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0041  16S ribosomal RNA  82.39 
 
 		 1538 bp  276  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0625865  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0059  16S ribosomal RNA  82.39 
 
 		 1538 bp  276  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0009  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1526 bp  274  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000875225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0049  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1526 bp  274  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000250907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0030  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1526 bp  274  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000520624  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1465  16S ribosomal RNA  80.23 
 
 		 1513 bp  274  7e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0060  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1526 bp  274  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0460  16S ribosomal RNA  80.23 
 
 		 1513 bp  274  7e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0517  16S ribosomal RNA  80.23 
 
 		 1513 bp  274  7e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.635993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0027  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1526 bp  274  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000250907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0021  16S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 1472 bp  272  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0008  16S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 1472 bp  272  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0066  16S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 1472 bp  272  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0923471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0079  16S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 1472 bp  272  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0035  16S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 1472 bp  272  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0041  16S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 1472 bp  272  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0052  16S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 1472 bp  272  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4294  16S ribosomal RNA  80.43 
 
 		 1464 bp  270  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11503  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4347  16S ribosomal RNA  80.43 
 
 		 1466 bp  270  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0586197  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4352  16S ribosomal RNA  80.43 
 
 		 1466 bp  270  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0002  16S ribosomal RNA  80.43 
 
 		 1460 bp  270  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1517 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1518 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1518 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1522 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  80.6 
 
 		 1517 bp  270  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0063  16S ribosomal RNA  80.43 
 
 		 1460 bp  270  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0057  16S ribosomal RNA  80.43 
 
 		 1460 bp  270  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.751599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0050  16S ribosomal RNA  80.43 
 
 		 1460 bp  270  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0053  16S ribosomal RNA  81.04 
 
 		 1480 bp  268  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0063  16S ribosomal RNA  81.04 
 
 		 1480 bp  268  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0005  16S ribosomal RNA  81.04 
 
 		 1480 bp  268  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0041  16S ribosomal RNA  80.06 
 
 		 1433 bp  266  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0018  16S ribosomal RNA  79.97 
 
 		 1476 bp  266  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0072  16S ribosomal RNA  79.97 
 
 		 1476 bp  266  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0010  16S ribosomal RNA  79.97 
 
 		 1476 bp  266  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0054  16S ribosomal RNA  79.97 
 
 		 1476 bp  266  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0001  16S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 1525 bp  266  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0059  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 		 1475 bp  264  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66406  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0033  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 		 1487 bp  264  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0021  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 		 1487 bp  264  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.779326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0070  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 		 1487 bp  264  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0051  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 		 1475 bp  264  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0029  16S ribosomal RNA  80.32 
 
 		 1475 bp  264  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560965  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0039  16S ribosomal RNA  85.5 
 
 		 1493 bp  262  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0021  16S ribosomal RNA  85.5 
 
 		 1493 bp  262  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R12  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1527 bp  260  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000170255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R41  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1527 bp  260  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000365903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R60  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1527 bp  260  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000806455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R81  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1527 bp  260  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231997  normal  0.0102575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R94  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1527 bp  260  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000210152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 1541 bp  258  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 1541 bp  258  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1543 bp  254  6e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0063  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1460 bp  254  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.29045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0055  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1460 bp  254  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0048  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1460 bp  254  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.211125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0036  16S ribosomal RNA  80.12 
 
 		 1460 bp  254  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.708988  normal  0.0771921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>